132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4387 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4387  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  513  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4148  TraR/DksA family transcriptional regulator  83.85 
 
 		 130 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4218  TraR/DksA family transcriptional regulator  83.85 
 
 		 130 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419171  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3299  TraR/DksA family transcriptional regulator  83.85 
 
 		 130 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1799  TraR/DksA family transcriptional regulator  80.77 
 
 		 130 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.392784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3641  TraR/DksA family transcriptional regulator  79.23 
 
 		 130 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4116  TraR/DksA family transcriptional regulator  79.23 
 
 		 130 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2311  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  62.79 
 
 		 131 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2024  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  62.02 
 
 		 131 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1419  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  62.02 
 
 		 131 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597542  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1334  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  62.02 
 
 		 131 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3205  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  62.02 
 
 		 131 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3077  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  62.02 
 
 		 131 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1047  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  64.66 
 
 		 117 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2314  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  65.71 
 
 		 105 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1557  hypothetical protein  38.64 
 
 		 132 aa  94.7  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0025  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 131 aa  94.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.795475  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2010  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  36.8 
 
 		 135 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0100  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 130 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1511  hypothetical protein  35.54 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  38.46 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1158  hypothetical protein  40.26 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.56 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1171  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2675  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.05 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242775  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4563  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.06 
 
 		 120 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.06 
 
 		 120 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3660  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 149 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  32.76 
 
 		 119 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4246  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.86 
 
 		 115 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0188  hypothetical protein  49.06 
 
 		 61 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 113 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 110 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3455  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 150 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0589339  normal  0.960962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3190  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.46 
 
 		 159 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0693  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30 
 
 		 130 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1632  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 114 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.16 
 
 		 121 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2782  transcriptional regulator, TraR/DksA family  60.53 
 
 		 128 aa  50.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  38.46 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  34.58 
 
 		 139 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.67 
 
 		 150 aa  50.4  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 139 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1823  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.68 
 
 		 130 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00591197 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4453  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 123 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.142377 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0973  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42 
 
 		 121 aa  49.3  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  38.24 
 
 		 122 aa  49.3  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  37 
 
 		 121 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0401  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.74 
 
 		 118 aa  49.3  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000019993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  38 
 
 		 121 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40860  hypothetical protein  45.76 
 
 		 108 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.802206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  28.57 
 
 		 130 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2396  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.69 
 
 		 130 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0818179  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 132 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 527 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1290  TraR/DksA family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 130 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.25 
 
 		 120 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0114  RNA polymerase-binding protein DksA  31.71 
 
 		 147 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000001721  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  33.61 
 
 		 129 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  40 
 
 		 118 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  29.76 
 
 		 117 aa  47.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2068  DnaK suppressor protein  31.2 
 
 		 149 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000191774  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 120 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0534  zinc finger DksA/TraR C4-type  29.29 
 
 		 119 aa  46.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781364  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2533  TraR/DksA family transcriptional regulator  42 
 
 		 139 aa  45.8  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0895997  normal  0.563175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1418  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 133 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0975581 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0238  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 		 120 aa  45.8  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 104 aa  45.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  29.13 
 
 		 118 aa  45.4  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44 
 
 		 154 aa  45.4  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  44 
 
 		 154 aa  45.4  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4693  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  33.33 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000772708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195272  hitchhiker  0.00000457182 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1754  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 118 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000650821  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0741  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000053151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  30.39 
 
 		 143 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  36.36 
 
 		 104 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0969  dnaK suppressor protein  28.21 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0480379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0835  hypothetical protein  29.52 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 124 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3895  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.03 
 
 		 124 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0249902  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.94 
 
 		 126 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2389  hypothetical protein  44.19 
 
 		 141 aa  43.5  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000590846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3620  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.76 
 
 		 122 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  34.34 
 
 		 110 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0780  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 147 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00166659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.67 
 
 		 120 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0939  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 118 aa  43.9  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  41.1 
 
 		 105 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1324  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 139 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1313  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3129  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 147 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.58 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3578  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 116 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.55 
 
 		 155 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3893  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 131 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1232  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 139 aa  42.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.182051 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0249  TraR/DksA family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 122 aa  42.7  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.534414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>