More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0238 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0238  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 		 120 aa  240  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  71.79 
 
 		 120 aa  175  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 120 aa  167  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 132 aa  167  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0008  transcriptional regulator, TraR/DksA family  60.83 
 
 		 120 aa  164  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0752856 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  60.83 
 
 		 120 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2611  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.39 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1504  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000779378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0401  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50.86 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000019993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  53.45 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.54 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.54 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.86 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  52.14 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0162  hypothetical protein  46.67 
 
 		 228 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0691  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0872386  normal  0.218793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 229 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.33 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000137678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0071  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0192  RNA polymerase-binding protein DksA  46.67 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2172  DnaK suppressor protein  46.67 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3255  DnaK suppressor protein  46.67 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  46.55 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0387  DnaK suppressor protein  46.67 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0995  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0166  DnaK suppressor protein  46.67 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2917  RNA polymerase-binding protein DksA  46.67 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3431  RNA polymerase-binding protein DksA  46.67 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0203  RNA polymerase-binding protein DksA  46.67 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0046  putative DNAK suppressor protein  44.17 
 
 		 139 aa  104  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4379  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 139 aa  104  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3107  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0344  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.83 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  45 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2999  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.141456 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6440  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2476  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3137  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3090  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 142 aa  103  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3835  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 162 aa  103  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.827568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0674  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  45 
 
 		 138 aa  103  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3085  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 138 aa  103  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 257 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.33 
 
 		 162 aa  102  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000740961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.33 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.55 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.83 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  44.83 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1232  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.182051 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.5 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0114  RNA polymerase-binding protein DksA  42.86 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000001721  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3381  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.83 
 
 		 223 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3704  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.83 
 
 		 223 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  45 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2552  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0402144  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 138 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.33 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  43.33 
 
 		 136 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0879  suppressor protein DksA  43.7 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0808  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 165 aa  100  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2993  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.83 
 
 		 223 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  42.5 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2014  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3295  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.17 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  42.5 
 
 		 133 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  42.5 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 139 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.59 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  42.5 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3585  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.845772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3438  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 429 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002565  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  42.5 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.5 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3683  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 281 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.83 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0509  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0780  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00166659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3060  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0497831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.83 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  42.86 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1032  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.55 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.955703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  45 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42640  RNA polymerase binding protein DksA  45.05 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.105027  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62490  suppressor protein DksA  45.95 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>