219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2925 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 
110 aa  217  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  62.73 
 
 
110 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.63 
 
 
121 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.9 
 
 
113 aa  96.7  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  58.33 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  62.5 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.82 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0973  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.41 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492217  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.33 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1511  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.32 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2860  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.14 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  29.25 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0100  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.9 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1267  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.59 
 
 
258 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120418  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.78 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3641  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.78 
 
 
130 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4116  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.78 
 
 
130 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4246  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.13 
 
 
115 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4148  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.78 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4218  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.78 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419171  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3299  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.78 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322172  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1511  hypothetical protein  37.76 
 
 
122 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1158  hypothetical protein  38.89 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1632  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.11 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  38.27 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1799  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.67 
 
 
130 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.392784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.48 
 
 
132 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22720  DnaK suppressor protein  33.62 
 
 
153 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.432466  normal  0.0927989 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4387  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.56 
 
 
256 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  38.36 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4563  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.36 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.36 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.36 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1313  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.11 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.27 
 
 
228 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.89 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 
150 aa  50.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.455354  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.69 
 
 
114 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.5 
 
 
176 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.55 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0401  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.9 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000019993  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  40.68 
 
 
129 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  33 
 
 
283 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.94 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.84 
 
 
213 aa  50.1  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3552  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.83 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.578946  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1363  transcriptional regulator, TraR/DksA family  26.92 
 
 
205 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000285999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  42.86 
 
 
118 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0188  hypothetical protein  48.89 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3682  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.19 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.594064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0693  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.83 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 
251 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3620  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.83 
 
 
122 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640003  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.81 
 
 
527 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2311  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  36.96 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3208  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.65 
 
 
218 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000145805  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1204  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.97 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.418656  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4024  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36 
 
 
222 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116599  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1047  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  38.04 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2314  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  38.04 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3190  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.66 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2024  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  38.04 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1419  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  38.04 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3578  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.51 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1126  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.08 
 
 
231 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00340237  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 
210 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1334  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  38.04 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3205  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  38.04 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3077  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  38.04 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1239  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.14 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0619111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2010  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  30.77 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0025  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.25 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.795475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.94 
 
 
212 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.48 
 
 
212 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.19 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.19 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.19 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  38.1 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1413  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.75 
 
 
112 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0152  transcriptional regulator, TraR/DksA family  57.78 
 
 
114 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.67 
 
 
120 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2687  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.55 
 
 
113 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0540586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  30.61 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0910  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.46 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2782  transcriptional regulator, TraR/DksA family  55.26 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.45 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0162  DnaK suppressor protein  27.43 
 
 
137 aa  47  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6415  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.73 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143253  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1926  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56.41 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3455  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.26 
 
 
150 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0589339  normal  0.960962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.99 
 
 
275 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  29.36 
 
 
243 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  45 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3660  TraR/DksA family transcriptional regulator  44 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.91 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3073  transcriptional regulator, TraR/DksA family protein  54.05 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.77 
 
 
234 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  29.41 
 
 
243 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>