More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1632 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1632  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 
114 aa  231  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6415  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.62 
 
 
110 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143253  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2860  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.37 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.08 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1158  hypothetical protein  54.35 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1511  hypothetical protein  36.75 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1063  DnaK suppressor protein  35.65 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00483953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.14 
 
 
118 aa  60.5  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3262  dnaK suppressor protein, putative  33.33 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3327  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.91 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0025  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.36 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.795475  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0100  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3682  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.77 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.594064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2220  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  32.32 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1844  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.32 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0449164  normal  0.0842967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3452  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.02 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0120  dnaK suppressor protein, putative  37.5 
 
 
120 aa  57.8  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0934145  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3519  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.32 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0696704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  36 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.95 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3487  dnaK suppressor protein, putative  32.32 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623059  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0160  dnaK suppressor protein, putative  36.25 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.532233  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0138  putative dnaK suppressor protein  38.03 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0008  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.75 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0752856 
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  33.05 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0534  zinc finger DksA/TraR C4-type  34 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781364  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0648  putative DnaK suppressor protein  38.64 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0693  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.92 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  33.05 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0152  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.47 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.57 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  33.33 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.05 
 
 
213 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1290  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.75 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.83 
 
 
216 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  29.66 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1823  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.35 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00591197 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1171  TraR/DksA family transcriptional regulator  44 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1557  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  45.83 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2396  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.35 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0818179  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.51 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1007  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.33 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.36 
 
 
124 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.37 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.11 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.83 
 
 
527 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.83 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2010  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  34.78 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2675  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.92 
 
 
132 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242775  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1267  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.5 
 
 
258 aa  52  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.83 
 
 
132 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0249  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.72 
 
 
122 aa  51.2  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.534414  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  32 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0162  DnaK suppressor protein  38.98 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225781  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.81 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.83 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.83 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2311  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.03 
 
 
139 aa  50.8  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.11 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4387  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.27 
 
 
256 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.29 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.92 
 
 
154 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  29.92 
 
 
154 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3299  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.31 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322172  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1754  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.01 
 
 
118 aa  50.4  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000650821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.62 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0939  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.72 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.83 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4148  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.31 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1239  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0619111 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4218  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.31 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419171  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  40 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.17 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0780  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00166659  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.81 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  30.28 
 
 
118 aa  50.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.58 
 
 
120 aa  50.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  38.46 
 
 
119 aa  50.1  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1094  dnaK suppressor protein, putative  33.68 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.360661  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  34.09 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.3 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4563  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  41.18 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0114  RNA polymerase-binding protein DksA  40 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000001721  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1324  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.68 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.91 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0401  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.05 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000019993  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.66 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2068  DnaK suppressor protein  40 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000191774  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  26.98 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1950  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.45 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>