298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3682 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3682  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 
111 aa  215  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.594064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  56.48 
 
 
110 aa  113  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  49.51 
 
 
108 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0744  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.22 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.186685  normal  0.0218217 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.63 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  44.12 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1413  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.31 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.67 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4329  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.38 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92957  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.71 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  32.11 
 
 
117 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.78 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.78 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  43.66 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.78 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1632  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.77 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.66 
 
 
132 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.14 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.05 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.11 
 
 
269 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.27 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.64 
 
 
251 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.58 
 
 
207 aa  57  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.98 
 
 
253 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0138  putative dnaK suppressor protein  31.48 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.02 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0120  dnaK suppressor protein, putative  30.56 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0934145  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0160  dnaK suppressor protein, putative  31.48 
 
 
120 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.532233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0152  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.38 
 
 
114 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.41 
 
 
210 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0964  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.57 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.633657  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2860  transcriptional regulator, TraR/DksA family  59.52 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1754  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.84 
 
 
118 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000650821  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  32.71 
 
 
243 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.19 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  39.19 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  41.18 
 
 
243 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4753  DksA/TraR family DNA-binding protein  31.78 
 
 
243 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000884601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4591  DnaK suppressor protein  31.78 
 
 
243 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000615326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4613  DnaK suppressor protein  31.78 
 
 
243 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000678403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  36.75 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5114  dksa/trar family DNA-binding protein  31.78 
 
 
243 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000229995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.71 
 
 
243 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  31.78 
 
 
243 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.03 
 
 
243 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56.1 
 
 
213 aa  53.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4971  DNA binding protein, DksA/TraR family  39.71 
 
 
243 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.34 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.46 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.91 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.22 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0648  putative DnaK suppressor protein  60.98 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0008  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.76 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0752856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4024  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.36 
 
 
222 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  38.24 
 
 
243 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3578  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.25 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  40.54 
 
 
283 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1198  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.5 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114031  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.28 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.581103  normal  0.0182397 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3208  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.91 
 
 
218 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000145805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.79 
 
 
176 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.05 
 
 
120 aa  50.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.62 
 
 
118 aa  50.4  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0534  zinc finger DksA/TraR C4-type  28.57 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781364  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0524  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.69 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114279  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0100  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.24 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1171  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.17 
 
 
116 aa  50.4  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.08 
 
 
527 aa  50.1  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2922  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.98 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.319958 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1886  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.98 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271081  decreased coverage  0.00232468 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.43 
 
 
228 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  62.86 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.02 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577167  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.97 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1063  DnaK suppressor protein  51.22 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00483953  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  40.91 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1772  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.71 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000102348  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  62.86 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.06 
 
 
257 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.19 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  56.41 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.05 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.45 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.41 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.41 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  56.41 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2396  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.21 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0818179  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.25 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1282  zinc finger DksA/TraR C4-type  45.45 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.41 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.83 
 
 
212 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0424  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.71 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00014325  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.7 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.94 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.5 
 
 
297 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56.41 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.85 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1990  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.95 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.4478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>