More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1309 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 
120 aa  237  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  95 
 
 
120 aa  229  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  95 
 
 
120 aa  229  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  95 
 
 
120 aa  229  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3895  transcriptional regulator, TraR/DksA family  58.33 
 
 
124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0249902  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  55.56 
 
 
118 aa  120  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  55.56 
 
 
118 aa  120  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.41 
 
 
118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  52.99 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  51.69 
 
 
118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.57 
 
 
118 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1504  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.67 
 
 
120 aa  103  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000779378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.86 
 
 
118 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.86 
 
 
120 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0401  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.15 
 
 
118 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000019993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2611  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.63 
 
 
120 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0008  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.53 
 
 
120 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0752856 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.94 
 
 
120 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 
158 aa  94  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.02 
 
 
139 aa  94  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.02 
 
 
139 aa  94  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 
138 aa  94  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0238  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.79 
 
 
120 aa  94  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.5 
 
 
132 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3835  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 
162 aa  93.6  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.827568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.02 
 
 
139 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.18 
 
 
139 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  41.18 
 
 
139 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  40.17 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.02 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.18 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 
120 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  41.18 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.34 
 
 
139 aa  90.5  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.34 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.86 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  39.5 
 
 
138 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  42.62 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0780  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 
147 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00166659  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  39.5 
 
 
138 aa  88.6  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 
138 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0874  DnaK suppressor protein  42.5 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.37 
 
 
118 aa  88.6  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3128  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.5 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000188351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.5 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0730  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.5 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697807  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3292  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.5 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000329302  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0884  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.5 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000326518  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0872  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.5 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000169398  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  41.18 
 
 
133 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3490  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.5 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869556  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0849  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.5 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000107681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  42.28 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  41.67 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.82 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  41.8 
 
 
138 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 
141 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3404  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.5 
 
 
147 aa  87  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000437132  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.8 
 
 
140 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0114  RNA polymerase-binding protein DksA  42.28 
 
 
147 aa  87  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000001721  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2340  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 
146 aa  87  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1164  RNA polymerase-binding transcription factor  41.94 
 
 
151 aa  87  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00894629  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0202  RNA polymerase-binding transcription factor  40.83 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210967  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0203  RNA polymerase-binding transcription factor  40.83 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0218  RNA polymerase-binding transcription factor  40.83 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.236664  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0220  RNA polymerase-binding transcription factor  40.83 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000337551  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.8 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0214  RNA polymerase-binding transcription factor  40.83 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.748319  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0685  RNA polymerase-binding transcription factor  40.83 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0013378  normal  0.581791 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00144  DNA-binding transcriptional regulator of rRNA transcription, DnaK suppressor protein  40 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3457  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1005  RNA polymerase-binding transcription factor  40 
 
 
182 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132792  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0154  RNA polymerase-binding transcription factor  40 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3129  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.94 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3114  RNA polymerase-binding transcription factor  41.94 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0231493  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2037  regulator RpoS  42.5 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.555499  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2819  RNA polymerase-binding transcription factor  40.83 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.02941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00143  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000224196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0149  RNA polymerase-binding transcription factor  40 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3468  RNA polymerase-binding transcription factor  40 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0312993  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.32 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3514  RNA polymerase-binding transcription factor  40 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000935377  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0136  RNA polymerase-binding transcription factor  40 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000300013  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3338  RNA polymerase-binding transcription factor  40 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000258197  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0156  RNA polymerase-binding transcription factor  40 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000187582  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0148  RNA polymerase-binding transcription factor  40 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000273463  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.66 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  40.17 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3899  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.94 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000283088  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.74 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.16 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3170  RNA polymerase-binding, DksA  40.83 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000043315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3937  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.34 
 
 
149 aa  84.3  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000139541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0698  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.18 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370209  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  37.5 
 
 
154 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.5 
 
 
154 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03545  putative DnaK suppressor protein  41.46 
 
 
152 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000789924  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0741  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.35 
 
 
147 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000053151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0906  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.83 
 
 
207 aa  84  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>