281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0152 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0152  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 
114 aa  224  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1007  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.56 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  54.84 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2860  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.82 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1632  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.62 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3208  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 
218 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000145805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.05 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54 
 
 
228 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.94 
 
 
213 aa  61.6  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.1 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1063  DnaK suppressor protein  45.65 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00483953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1290  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.03 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.19 
 
 
212 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  56.25 
 
 
132 aa  59.3  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0648  putative DnaK suppressor protein  42.17 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1823  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.77 
 
 
130 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00591197 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  49.12 
 
 
176 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2396  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.77 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0818179  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  39.22 
 
 
283 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.45 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.14 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1313  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.02 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  46.15 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4024  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.98 
 
 
222 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4329  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.85 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92957  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.15 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3682  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.38 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.594064 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1363  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000285999  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1267  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.33 
 
 
258 aa  55.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120418  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.06 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.21 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3190  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.29 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.71 
 
 
275 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1282  zinc finger DksA/TraR C4-type  37.23 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.82 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2439  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.33 
 
 
115 aa  53.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.734932  normal  0.693819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.11 
 
 
216 aa  53.5  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.81 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.06 
 
 
527 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.86 
 
 
210 aa  53.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  44.23 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0120  dnaK suppressor protein, putative  28.72 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0934145  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0162  DnaK suppressor protein  38.57 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225781  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0534  zinc finger DksA/TraR C4-type  31.53 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781364  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0138  putative dnaK suppressor protein  27.66 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  37.14 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0160  dnaK suppressor protein, putative  27.66 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.532233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1511  hypothetical protein  50.94 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.04 
 
 
150 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.455354  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1858  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.4 
 
 
206 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.663069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40860  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.802206  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22720  DnaK suppressor protein  36.08 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.432466  normal  0.0927989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.17 
 
 
251 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.31 
 
 
108 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  57.5 
 
 
253 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.61 
 
 
207 aa  50.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1324  TraR/DksA family transcriptional regulator  46 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820819  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.99 
 
 
234 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0631  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50.88 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  4.19152e-36 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0617  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50.88 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000439972  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6194  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.4 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643826  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  32.17 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3095  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.73 
 
 
145 aa  50.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000335768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  50 
 
 
122 aa  50.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2631  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0800447  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1418  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.85 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0975581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.68 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2535  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3206  dnaK suppressor protein, putative  47.37 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000255465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0715  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.37 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000696876  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1158  hypothetical protein  46.43 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.29 
 
 
243 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.28 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4453  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.03 
 
 
123 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.142377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.65 
 
 
257 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.43 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3204  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.12 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.15399e-17  unclonable  7.046940000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1198  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.73 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114031  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.46 
 
 
243 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.58 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4753  DksA/TraR family DNA-binding protein  34.83 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000884601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4591  DnaK suppressor protein  34.83 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000615326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4613  DnaK suppressor protein  34.83 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000678403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5114  dksa/trar family DNA-binding protein  34.83 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000229995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0693  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.17 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  33.71 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  32.58 
 
 
243 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4875  hypothetical protein  41.18 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107762  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0486  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.67 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1557  hypothetical protein  34.41 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2904  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.95 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000908818  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1171  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.38 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0167  putative DnaK suppressor  26.36 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000243735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  44.44 
 
 
243 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1990  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.22 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.4478  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3508  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.13 
 
 
127 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.31 
 
 
137 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>