158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0648 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0648  putative DnaK suppressor protein  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4875  hypothetical protein  43.53 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2860  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.57 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0152  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.77 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1632  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 114 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0650  hypothetical protein  38.96 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.374747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.28 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3682  transcriptional regulator, TraR/DksA family  60.98 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.594064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2384  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  52.38 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0693  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.46 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1511  hypothetical protein  44.23 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  42 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1158  hypothetical protein  42.25 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  48.21 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  48 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 257 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  40.82 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  44 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1413  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  35.42 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.27 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.62 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0008  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.62 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0752856 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0120  dnaK suppressor protein, putative  34.04 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0934145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1063  DnaK suppressor protein  43.48 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00483953  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.25 
 
 		 114 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0188  hypothetical protein  43.48 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1007  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1324  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820819  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0160  dnaK suppressor protein, putative  34.04 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.532233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  42 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0138  putative dnaK suppressor protein  34.04 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.58 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000740961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0100  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6416  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.19 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0580522  hitchhiker  0.0061347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3552  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.22 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.578946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3620  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.22 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640003  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.42 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.82 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.3 
 
 		 213 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.28 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2535  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.82 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2631  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.82 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0800447  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.56 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  39.22 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0025  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.795475  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.22 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000137678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.35 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.74 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  42 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4563  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.07 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.07 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.51 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4329  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.1 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  31.91 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2904  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000908818  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.25 
 
 		 118 aa  43.9  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  39.62 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  35.14 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0916  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354828  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1290  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  39.62 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  39.62 
 
 		 138 aa  42.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3578  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1032  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.955703  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.51 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.62 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1823  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.96 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00591197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.78 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2396  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.96 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0818179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  29.51 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0691  TraR/DksA family transcriptional regulator  36 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0872386  normal  0.218793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1430  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3895  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0249902  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  34.88 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1500  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0238  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>