90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1430 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1430  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  209  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1803  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  39.81 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.2 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0680  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0997736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1266  dnaK suppressor protein  40.24 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0916  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354828  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.23 
 
 		 253 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.27 
 
 		 213 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  51.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3066  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.446011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  42.11 
 
 		 283 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  37.5 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0604  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.64 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2884  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.36 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.17875  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.36 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1800  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 105 aa  48.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1477  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 105 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3190  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.69 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1063  DnaK suppressor protein  33.02 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00483953  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1267  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 258 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40860  hypothetical protein  41.05 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.802206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1858  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.663069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.46 
 
 		 228 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0166  DnaK suppressor protein  32.04 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 234 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.11 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.11 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1413  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.61 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  38.57 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0486  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.14 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1418  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0975581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.27 
 
 		 269 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0973  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.18 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  53.49 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2384  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68054 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2698  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2552  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0402144  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.22 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.414377  normal  0.0706919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.36 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22720  DnaK suppressor protein  44.44 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.432466  normal  0.0927989 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.29 
 
 		 216 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.15 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220382  normal  0.38393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4329  transcriptional regulator, TraR/DksA family  55.81 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  35.29 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 257 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0648  putative DnaK suppressor protein  32.81 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1977  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  50 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1126  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.1 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0401  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.23 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000019993  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.26 
 
 		 118 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1324  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820819  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  43.86 
 
 		 110 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.19 
 
 		 144 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 118 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0964  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.633657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  31.25 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1282  zinc finger DksA/TraR C4-type  36.11 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  30.21 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0910  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.84 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1184  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1411  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2611  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 527 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  43.86 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.87 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.14 
 
 		 275 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.82 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.82 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0180  TraR/DksA family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000132063  normal  0.0556483 
 
 
-
 
NC_002936  DET1373  dnaK suppressor protein, putative  38.89 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000567795  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1154  DnaK suppressor protein-like protein  38.89 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136974  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 		 141 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>