220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1267 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1267  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 
258 aa  497  1e-140  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120418  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.48 
 
 
121 aa  72  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3208  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.67 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000145805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.25 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.25 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.48 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1823  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.45 
 
 
130 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00591197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2396  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.45 
 
 
130 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0818179  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0534  zinc finger DksA/TraR C4-type  39.24 
 
 
119 aa  63.5  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781364  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  39.73 
 
 
119 aa  62.8  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1418  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.43 
 
 
133 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0975581 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.95 
 
 
150 aa  59.7  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  33.77 
 
 
117 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3206  dnaK suppressor protein, putative  43.24 
 
 
139 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000255465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48 
 
 
210 aa  58.9  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.71 
 
 
150 aa  58.9  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.56 
 
 
139 aa  58.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  30.56 
 
 
139 aa  58.5  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3204  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.89 
 
 
139 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.15399e-17  unclonable  7.046940000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.36 
 
 
155 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.88 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22720  DnaK suppressor protein  27.89 
 
 
153 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.432466  normal  0.0927989 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0973  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.78 
 
 
121 aa  56.2  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.78 
 
 
118 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  30.08 
 
 
283 aa  55.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.78 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0401  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.71 
 
 
118 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000019993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  34.48 
 
 
118 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4024  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.11 
 
 
222 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 
118 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.75 
 
 
212 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.29 
 
 
207 aa  55.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.14 
 
 
118 aa  55.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.57 
 
 
114 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0152  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.9 
 
 
114 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36 
 
 
120 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1282  zinc finger DksA/TraR C4-type  34.48 
 
 
152 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.59 
 
 
110 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0691  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.62 
 
 
139 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0872386  normal  0.218793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3095  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.89 
 
 
145 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000335768  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0160  dnaK suppressor protein, putative  34.78 
 
 
120 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.532233  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.88 
 
 
150 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.455354  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  28.04 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.43 
 
 
118 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0715  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.63 
 
 
139 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000696876  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.14 
 
 
212 aa  53.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  42 
 
 
122 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0138  putative dnaK suppressor protein  34.78 
 
 
120 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0120  dnaK suppressor protein, putative  34.78 
 
 
120 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0934145  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.88 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35 
 
 
115 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.38 
 
 
124 aa  52.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.46 
 
 
527 aa  52.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2552  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.9 
 
 
140 aa  52.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0402144  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0879  suppressor protein DksA  29.06 
 
 
145 aa  52.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1063  DnaK suppressor protein  31.53 
 
 
127 aa  52  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00483953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1632  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.5 
 
 
114 aa  52  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  34 
 
 
130 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0910  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.1 
 
 
136 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.7 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.3 
 
 
297 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 
176 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0674  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.46 
 
 
146 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1373  dnaK suppressor protein, putative  47.83 
 
 
123 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000567795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  29.13 
 
 
118 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.86 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.13 
 
 
118 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.13 
 
 
118 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1363  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.9 
 
 
205 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000285999  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1154  DnaK suppressor protein-like protein  47.83 
 
 
122 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136974  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2860  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.55 
 
 
106 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1452  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.19 
 
 
147 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0860961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0631  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.49 
 
 
139 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  4.19152e-36 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.83 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0617  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.49 
 
 
139 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000439972  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  36.92 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.19 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1184  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.83 
 
 
123 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6415  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 
110 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143253  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2884  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.04 
 
 
144 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.17875  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  27.59 
 
 
118 aa  49.3  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1324  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.43 
 
 
139 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820819  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.46 
 
 
126 aa  49.3  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.56 
 
 
275 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.04 
 
 
144 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.85 
 
 
118 aa  49.3  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6416  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.31 
 
 
120 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0580522  hitchhiker  0.0061347 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 
129 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.414377  normal  0.0706919 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.4 
 
 
120 aa  48.9  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  39.13 
 
 
132 aa  48.9  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1290  TraR/DksA family transcriptional regulator  29 
 
 
130 aa  48.9  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.95 
 
 
120 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.25 
 
 
132 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.95 
 
 
120 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.95 
 
 
120 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.95 
 
 
120 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  32 
 
 
120 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2922  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 
151 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.319958 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  36.92 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>