More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2884 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 
144 aa  285  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2884  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 
144 aa  285  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.17875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2698  TraR/DksA family transcriptional regulator  93.75 
 
 
144 aa  242  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  71.32 
 
 
129 aa  180  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.414377  normal  0.0706919 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.84 
 
 
257 aa  68.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.04 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.04 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.04 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.14 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.65 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.62 
 
 
118 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.62 
 
 
118 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.43 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  30.84 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.8 
 
 
210 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0138  putative dnaK suppressor protein  28.07 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1858  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.43 
 
 
206 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.663069  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1413  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.48 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1803  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.66 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488445  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0160  dnaK suppressor protein, putative  28.07 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.532233  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0486  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.36 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  40.66 
 
 
283 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  35.16 
 
 
104 aa  58.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0120  dnaK suppressor protein, putative  28.07 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0934145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.74 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.43 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.581103  normal  0.0182397 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  29.2 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  34.33 
 
 
236 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0910  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.74 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0166  DnaK suppressor protein  38.61 
 
 
105 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1754  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.03 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000650821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.87 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1266  dnaK suppressor protein  37.74 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1800  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.61 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.65 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1418  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.42 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0975581 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0973  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.38 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492217  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.5 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0916  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.76 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354828  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.5 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.26 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.97 
 
 
527 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  31.5 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  31.5 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1282  zinc finger DksA/TraR C4-type  44.23 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1977  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.94 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.93 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4329  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.34 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92957  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  34.19 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1766  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.7 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1846  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.7 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0604  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.1 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.31 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2110  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.7 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2340  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.23 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22720  DnaK suppressor protein  43.42 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.432466  normal  0.0927989 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2037  regulator RpoS  29.46 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.555499  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.61 
 
 
143 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3208  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.37 
 
 
218 aa  53.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000145805  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3066  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.67 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.446011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  35.51 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.9 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000137678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.89 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0167  putative DnaK suppressor  40.98 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000243735  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.26 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0939  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.31 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  34.26 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.52 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.9 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.39 
 
 
275 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.09 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.43 
 
 
212 aa  52.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4011  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.43 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00055516  normal  0.87616 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2243  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.11 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.176071  hitchhiker  0.000769405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  32.5 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1171  TraR/DksA family transcriptional regulator  25.86 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1477  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.85 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.24 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.11 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.47 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.455354  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.45 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.75 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.26 
 
 
139 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.26 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.26 
 
 
139 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2595  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.96 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0724  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.96 
 
 
153 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.03 
 
 
212 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4024  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.44 
 
 
222 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116599  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.24 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1007  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.35 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.77 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0534  zinc finger DksA/TraR C4-type  32.22 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.52 
 
 
133 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0238  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.1 
 
 
120 aa  50.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  31.43 
 
 
117 aa  50.4  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.5 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  36.63 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>