173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1184 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1184  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 
123 aa  248  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1154  DnaK suppressor protein-like protein  94.26 
 
 
122 aa  214  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1373  dnaK suppressor protein, putative  91.87 
 
 
123 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000567795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.28 
 
 
210 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  36.84 
 
 
236 aa  60.1  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.82 
 
 
213 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.46 
 
 
527 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  35.9 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.1 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.1 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.9 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.98 
 
 
275 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0534  zinc finger DksA/TraR C4-type  35.48 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.73 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.75 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.455354  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3190  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0160  dnaK suppressor protein, putative  40.74 
 
 
120 aa  53.9  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.532233  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  31.68 
 
 
122 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0138  putative dnaK suppressor protein  40.74 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  47.92 
 
 
283 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0120  dnaK suppressor protein, putative  40.74 
 
 
120 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0934145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.5 
 
 
155 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.89 
 
 
253 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3895  transcriptional regulator, TraR/DksA family  49.02 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0249902  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  32.71 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.28 
 
 
212 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.36 
 
 
234 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0910  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.68 
 
 
136 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.7 
 
 
114 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4024  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.68 
 
 
222 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116599  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.96 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  36.36 
 
 
132 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.36 
 
 
132 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.29 
 
 
150 aa  50.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  40 
 
 
117 aa  50.4  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1063  DnaK suppressor protein  34.75 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00483953  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0680  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.85 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0997736  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22720  DnaK suppressor protein  33.75 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.432466  normal  0.0927989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1418  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.68 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0975581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  28.45 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1267  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.33 
 
 
258 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120418  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.96 
 
 
207 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.65 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  35.64 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3660  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.06 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.29 
 
 
243 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.71 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2110  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.04 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1846  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.04 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1766  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.04 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1171  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.57 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1803  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.91 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488445  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1292  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.56 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359698  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.17 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.414377  normal  0.0706919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  35 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.96 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40860  hypothetical protein  48.78 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.802206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1858  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.39 
 
 
206 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.663069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.96 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3208  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.62 
 
 
218 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000145805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  30.7 
 
 
243 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0964  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.8 
 
 
147 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.633657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6338  RNA polymerase-binding protein DksA  47.46 
 
 
134 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4971  DNA binding protein, DksA/TraR family  28.81 
 
 
243 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.36 
 
 
243 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 
119 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.581103  normal  0.0182397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  34.72 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.7 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  38.71 
 
 
243 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.85 
 
 
257 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.3 
 
 
108 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3066  TraR/DksA family transcriptional regulator  27.83 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.446011 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1754  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.74 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000650821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  38.71 
 
 
243 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  34 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0152  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.98 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4753  DksA/TraR family DNA-binding protein  28.81 
 
 
243 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000884601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4591  DnaK suppressor protein  28.81 
 
 
243 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000615326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4613  DnaK suppressor protein  29.82 
 
 
243 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000678403  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.4 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5114  dksa/trar family DNA-binding protein  28.81 
 
 
243 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000229995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73020  DksA/TraR family C4-type zinc finger protein  45.76 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450272  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0238  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.23 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.14 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.4 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1324  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.52 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.18 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44 
 
 
228 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  29.82 
 
 
243 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.04 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4875  hypothetical protein  34.72 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107762  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.18 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.18 
 
 
216 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.18 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.92 
 
 
251 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.51 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.41 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000137678  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2631  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.52 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0800447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2535  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.52 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>