95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4875 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4875  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  261  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0648  putative DnaK suppressor protein  43.53 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  34.91 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  47.27 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0650  hypothetical protein  41.89 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.374747  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3895  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.88 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0249902  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2860  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.14 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0152  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.18 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  46.15 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4453  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.142377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.11 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3073  transcriptional regulator, TraR/DksA family protein  48.72 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 257 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1504  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000779378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1413  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.28 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  55.56 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.13 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.13 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1184  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.51 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.82 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2893  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0224708 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1858  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 206 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.663069  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1171  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.43 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.455354  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  41.3 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 		 228 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0238  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.78 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.35 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5995  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.78 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1632  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4537  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1290  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3190  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.42 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.5 
 
 		 275 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  43.48 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0534  zinc finger DksA/TraR C4-type  28.41 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781364  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2595  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22970  RNA polymerase-binding DksA like protein  40.82 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6338  RNA polymerase-binding protein DksA  41.67 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1511  hypothetical protein  40.91 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0120  dnaK suppressor protein, putative  34.88 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0934145  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000740961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73020  DksA/TraR family C4-type zinc finger protein  41.67 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1500  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 143 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.581103  normal  0.0182397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4329  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 		 117 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0100  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.62 
 
 		 126 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  33.93 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.71 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0160  dnaK suppressor protein, putative  34.88 
 
 		 120 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.532233  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  35.71 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1418  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 133 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0975581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  43.48 
 
 		 122 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3682  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42 
 
 		 111 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.594064 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0138  putative dnaK suppressor protein  34.88 
 
 		 120 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0910  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.43 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2439  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.734932  normal  0.693819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.96 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 527 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.96 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.59 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  33.33 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2884  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.64 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.17875  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  47.5 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1154  DnaK suppressor protein-like protein  35.71 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.64 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  43.18 
 
 		 283 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1373  dnaK suppressor protein, putative  35.71 
 
 		 123 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000567795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.93 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000137678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0693  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.9 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2698  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0879  suppressor protein DksA  52.94 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.76 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  32.76 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 138 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.19 
 
 		 176 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.3 
 
 		 150 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  32.76 
 
 		 146 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>