More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0421 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 		 119 aa  233  8e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.581103  normal  0.0182397 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2384  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.46 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1977  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2555  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4199  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124455  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4470  putative DnaK suppressor protein  46.36 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000149172  hitchhiker  0.00792418 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4602  putative DnaK suppressor protein  46.36 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000114617  normal  0.012222 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1573  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.36 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1993  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0188  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2385  hypothetical protein  47.79 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2786  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3893  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0169  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.24 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.2184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2328  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.29 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3073  transcriptional regulator, TraR/DksA family protein  38.1 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  41.12 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.71 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.9 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2884  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.43 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.17875  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.43 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3949  DnaK suppressor protein, putative  36.21 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442738 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0916  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354828  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  37.86 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  51.11 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1171  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.414377  normal  0.0706919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2035  serine phosphatase  35.63 
 
 		 341 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000137678  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 257 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  50 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1007  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  50 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0674  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 229 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 158 aa  52.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1032  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.4 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.955703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3578  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.36 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.91 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.9 
 
 		 213 aa  52  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5439  suppressor protein DksA  51.11 
 
 		 148 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3585  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.845772 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1411  transcriptional regulator  53.33 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  48 
 
 		 138 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0680  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0997736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40860  hypothetical protein  46.67 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.802206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42640  RNA polymerase binding protein DksA  51.11 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.105027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62490  suppressor protein DksA  51.11 
 
 		 148 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0995  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0604  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  48 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.19 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  48 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  34.78 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  44 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0008  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.86 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0752856 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.08 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  48 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000740961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1858  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.663069  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1477  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.19 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  48.89 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  48.98 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3682  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.28 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.594064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.67 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  28.12 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1803  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  50.8  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488445  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1266  dnaK suppressor protein  54.17 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  46.94 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1192  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 158 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.11 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4537  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  46 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1198  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3085  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0964  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.633657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>