145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2786 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2786  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  219  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2555  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4199  hypothetical protein  54.88 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124455  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2384  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68054 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.581103  normal  0.0182397 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1977  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0188  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1993  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4470  putative DnaK suppressor protein  45 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000149172  hitchhiker  0.00792418 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4602  putative DnaK suppressor protein  45 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000114617  normal  0.012222 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1573  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2385  hypothetical protein  48 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3893  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0169  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.28 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.2184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3073  transcriptional regulator, TraR/DksA family protein  42.55 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2687  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0540586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3949  DnaK suppressor protein, putative  40.21 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3660  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1926  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.64 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  45.9 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  48 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2328  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.97 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  48 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3682  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.98 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.594064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0916  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354828  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1198  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2105  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.8303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.38 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1411  transcriptional regulator  50 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0008  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.68 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0752856 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2552  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0402144  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  37.74 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1007  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0693  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.43 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  45.1 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  34.09 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.68 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  44 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1800  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.98 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3552  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.22 
 
 		 122 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.578946  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3620  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.22 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640003  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  50 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1171  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000740961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.4 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.37 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.67 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.58 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0166  DnaK suppressor protein  41.67 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0744  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.06 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.186685  normal  0.0218217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  46 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0180  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000132063  normal  0.0556483 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.43 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2860  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.48 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22720  DnaK suppressor protein  51.35 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.432466  normal  0.0927989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.16 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0604  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3578  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.71 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000137678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.41 
 
 		 228 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 257 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2893  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0224708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0401  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000019993  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1094  dnaK suppressor protein, putative  40.43 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.360661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  41.86 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1477  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1324  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820819  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.86 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  32.76 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 527 aa  43.9  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1363  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.22 
 
 		 205 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000285999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1557  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2675  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  45 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.34 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  42.22 
 
 		 122 aa  42.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.34 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2535  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2286  hypothetical protein  45.24 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2259  hypothetical protein  45.24 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0691  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0872386  normal  0.218793 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.47 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0648  putative DnaK suppressor protein  41.86 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  46.34 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0995  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.08 
 
 		 110 aa  42  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0238  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.43 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>