175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0166 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0166  DnaK suppressor protein  100 
 
 
105 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1800  TraR/DksA family transcriptional regulator  99.05 
 
 
105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1477  TraR/DksA family transcriptional regulator  90.48 
 
 
105 aa  194  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0916  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.47 
 
 
106 aa  90.1  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354828  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1266  dnaK suppressor protein  44.66 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0604  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.36 
 
 
114 aa  83.6  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  44.23 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  40.43 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.3 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.25 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1803  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.7 
 
 
106 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40860  hypothetical protein  34.29 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.802206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2884  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.61 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.17875  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.61 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1204  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.96 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.418656  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1198  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.1 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114031  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2698  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.24 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.7 
 
 
109 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.65 
 
 
121 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2555  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.21 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.414377  normal  0.0706919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.11 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1007  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.55 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.83 
 
 
216 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  31.87 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2385  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309687  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0680  TraR/DksA family transcriptional regulator  27.84 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0997736  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1993  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.65 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4329  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.07 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92957  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0486  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.46 
 
 
210 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1754  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.93 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000650821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1126  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 
231 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00340237  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.03 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.581103  normal  0.0182397 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.86 
 
 
228 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0674  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.51 
 
 
146 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.57 
 
 
257 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  45.65 
 
 
130 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  34.91 
 
 
110 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2707  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.69 
 
 
133 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.52 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  46.51 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1063  DnaK suppressor protein  40.35 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00483953  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1452  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0860961  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0973  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.78 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492217  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  48.84 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.84 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.38 
 
 
212 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4011  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.19 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00055516  normal  0.87616 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0939  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.9 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1411  transcriptional regulator  38.46 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10808  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2328  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.1 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1430  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.29 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.54 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  27.45 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4024  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.43 
 
 
222 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116599  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.54 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0167  putative DnaK suppressor  31.88 
 
 
125 aa  44.7  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000243735  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1171  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.28 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1363  transcriptional regulator, TraR/DksA family  26.04 
 
 
205 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000285999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3620  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640003  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3060  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.86 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0497831  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.86 
 
 
176 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.33 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0584  RNA polymerase-binding dnaK suppressor protein DksA  44.19 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.62 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.62 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0180  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.51 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000132063  normal  0.0556483 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4691  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.51 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000577976 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3552  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.578946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3949  DnaK suppressor protein, putative  48.57 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.442738 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1858  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.18 
 
 
206 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.663069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.51 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2105  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.45 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.8303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.19 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000137678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3937  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.19 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000139541  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.34 
 
 
212 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  31 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.43 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2037  regulator RpoS  44.19 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.555499  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0691  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.86 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0872386  normal  0.218793 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0008  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.51 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0752856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22720  DnaK suppressor protein  32.73 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.432466  normal  0.0927989 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2340  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.19 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3208  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.48 
 
 
218 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000145805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03545  putative DnaK suppressor protein  44.19 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000789924  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0780  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.19 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00166659  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  48.84 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2552  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.86 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0402144  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.19 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000740961  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.84 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3295  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.51 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013948  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  42.22 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.57 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1290  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.46 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4199  hypothetical protein  44.19 
 
 
111 aa  42  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2605  DnaK suppressor protein  41.86 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.422006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3372  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.86 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.911345  normal  0.0274052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0741  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.19 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000053151 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  26.97 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>