155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1803 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1803  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 
106 aa  213  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488445  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1430  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.49 
 
 
106 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.44 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  45.07 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0166  DnaK suppressor protein  36.7 
 
 
105 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.5 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1800  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.7 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1477  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.61 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0916  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.84 
 
 
106 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354828  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.79 
 
 
129 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.414377  normal  0.0706919 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2884  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.66 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.17875  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.66 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0680  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.04 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0997736  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.53 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40860  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.802206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.79 
 
 
257 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0604  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.78 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2698  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.25 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.29 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1063  DnaK suppressor protein  33.96 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00483953  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220382  normal  0.38393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.46 
 
 
212 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  35.53 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1266  dnaK suppressor protein  42.42 
 
 
105 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1977  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.79 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.64 
 
 
121 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 
119 aa  50.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.581103  normal  0.0182397 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1282  zinc finger DksA/TraR C4-type  39.71 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.08 
 
 
527 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.34 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3208  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.25 
 
 
218 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000145805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5217  hypothetical protein  47.83 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  43.48 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  41.27 
 
 
283 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.84 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  46.51 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1413  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.5 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.51 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0486  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.9 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60560  hypothetical protein  46.38 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.654182 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.65 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.31 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.74 
 
 
212 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.64 
 
 
253 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  44.9 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  43.75 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  35 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1007  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.65 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.83 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.15 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1184  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.91 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.55 
 
 
216 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.84 
 
 
213 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  31.25 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  44.9 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1267  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.75 
 
 
258 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120418  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1032  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.66 
 
 
151 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.955703  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0995  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.62 
 
 
144 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.33 
 
 
228 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0910  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.13 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2611  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.65 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4024  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.45 
 
 
222 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.73 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1363  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.55 
 
 
205 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000285999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1324  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.87 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.19 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.19 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2384  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.65 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.68054 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0249  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.04 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.534414  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0674  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.62 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.22 
 
 
234 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  43.9 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.9 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0973  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.71 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.19 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1823  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.13 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00591197 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.75 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  33.98 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1198  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114031  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.55 
 
 
210 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.19 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.45 
 
 
176 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3660  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.21 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0964  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.633657  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  43.48 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2396  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.13 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0818179  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0169  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.2184  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3190  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.31 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.48 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0401  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.78 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000019993  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  33.8 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.31 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.455354  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22720  DnaK suppressor protein  44.23 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.432466  normal  0.0927989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3682  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.594064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.82 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3060  TraR/DksA family transcriptional regulator  34 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0497831  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.46 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0152  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.65 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>