282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0680 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0680  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 
109 aa  226  6e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0997736  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  67.59 
 
 
109 aa  161  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0604  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.29 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.65 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0486  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.55 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  46.58 
 
 
236 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  36.7 
 
 
105 aa  59.3  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.88 
 
 
253 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.11 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.11 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.11 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1803  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.04 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488445  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0744  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.41 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.186685  normal  0.0218217 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.08 
 
 
228 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4613  DnaK suppressor protein  42.62 
 
 
243 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000678403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  58.97 
 
 
243 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.19 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.41 
 
 
243 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  58.97 
 
 
243 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1282  zinc finger DksA/TraR C4-type  31.63 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  42.86 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4753  DksA/TraR family DNA-binding protein  40.98 
 
 
243 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000884601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4591  DnaK suppressor protein  40.98 
 
 
243 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000615326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5114  dksa/trar family DNA-binding protein  40.98 
 
 
243 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000229995  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  35.71 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.97 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  56.41 
 
 
243 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  56.41 
 
 
243 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40860  hypothetical protein  36.27 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.802206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.78 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4971  DNA binding protein, DksA/TraR family  56.41 
 
 
243 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.55 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.28 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.28 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0916  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.02 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354828  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.41 
 
 
243 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  38.2 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.61 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  40.62 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.26 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.62 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.84 
 
 
275 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1192  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.62 
 
 
158 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.79 
 
 
138 aa  53.5  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.03 
 
 
120 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  31.71 
 
 
283 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.79 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.73 
 
 
269 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.5 
 
 
212 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1430  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.9 
 
 
106 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.94 
 
 
234 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.79 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1511  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.64 
 
 
111 aa  52.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1477  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.57 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.11 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.53 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.92 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3895  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.36 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0249902  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.76 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.17 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.581103  normal  0.0182397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.91 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0547  TraR/DksA family transcriptional regulator  33 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.3 
 
 
155 aa  52  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  41.79 
 
 
139 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.79 
 
 
138 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.3 
 
 
138 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.79 
 
 
139 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.36 
 
 
118 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.36 
 
 
118 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.79 
 
 
139 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.79 
 
 
139 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_002936  DET1373  dnaK suppressor protein, putative  53.85 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000567795  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1154  DnaK suppressor protein-like protein  53.85 
 
 
122 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0203  RNA polymerase-binding protein DksA  42.65 
 
 
138 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3431  RNA polymerase-binding protein DksA  42.65 
 
 
138 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3255  DnaK suppressor protein  42.65 
 
 
138 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0192  RNA polymerase-binding protein DksA  42.65 
 
 
138 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  41.27 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0387  DnaK suppressor protein  42.65 
 
 
138 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0166  DnaK suppressor protein  42.65 
 
 
138 aa  50.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.09 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0238  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.19 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.73 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2172  DnaK suppressor protein  42.65 
 
 
138 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297381  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2917  RNA polymerase-binding protein DksA  42.65 
 
 
138 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123295  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  40.3 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.26 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  40.3 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.31 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3085  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.65 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.33 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1418  TraR/DksA family transcriptional regulator  27.27 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0975581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  32.65 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.3 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.3 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.73 
 
 
229 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.61 
 
 
158 aa  50.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0724  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.81 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1184  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.85 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.3 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>