236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0744 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0744  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 
112 aa  212  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.186685  normal  0.0218217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  62.03 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50.96 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  55.21 
 
 
110 aa  90.5  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3682  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.22 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.594064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1413  transcriptional regulator, TraR/DksA family  49.51 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  44.44 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.79 
 
 
253 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.43 
 
 
109 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.85 
 
 
243 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4246  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.55 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4753  DksA/TraR family DNA-binding protein  40.85 
 
 
243 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000884601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4591  DnaK suppressor protein  40.85 
 
 
243 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000615326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5114  dksa/trar family DNA-binding protein  40.85 
 
 
243 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000229995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  42.86 
 
 
243 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  40.85 
 
 
243 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4613  DnaK suppressor protein  41.43 
 
 
243 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000678403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  42.86 
 
 
243 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0680  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.41 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0997736  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4971  DNA binding protein, DksA/TraR family  40.85 
 
 
243 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.53 
 
 
269 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.85 
 
 
243 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4329  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.29 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92957  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  41.43 
 
 
243 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.61 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.57 
 
 
212 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  54.9 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.9 
 
 
527 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.1 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.83 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  61.9 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0724  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.1 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.54 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.1 
 
 
216 aa  50.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  38.18 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  56.1 
 
 
158 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.1 
 
 
158 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  53.66 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  53.66 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0167  putative DnaK suppressor  25.23 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000243735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56.1 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.66 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.1 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4537  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.61 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.38 
 
 
234 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56.1 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2884  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.03 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.17875  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.15 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.66 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.22 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.66 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.03 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0486  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.71 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.29 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1192  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.1 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.49 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.66 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.28 
 
 
212 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6338  RNA polymerase-binding protein DksA  35.9 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.22 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  51.22 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22970  RNA polymerase-binding DksA like protein  56.1 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.66 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.31 
 
 
275 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.22 
 
 
120 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.22 
 
 
120 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2698  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.59 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.22 
 
 
120 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  51.22 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.78 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.78 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.78 
 
 
146 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 
126 aa  47.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.66 
 
 
142 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.22 
 
 
158 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  52 
 
 
121 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0547  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.71 
 
 
140 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.22 
 
 
120 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.22 
 
 
138 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.11 
 
 
138 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.89 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3660  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.51 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1313  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.71 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73020  DksA/TraR family C4-type zinc finger protein  53.66 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450272  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.1 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.74 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.79 
 
 
257 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.78 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.02 
 
 
162 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3578  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.38 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  48.78 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.66 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.22 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2860  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.98 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  48.78 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.02 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1511  transcriptional regulator, TraR/DksA family  49.06 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3895  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.34 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0249902  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.34 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  34.02 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>