111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4246 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4246  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 
115 aa  221  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.64 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  53.42 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  53.42 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  52.05 
 
 
243 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4971  DNA binding protein, DksA/TraR family  52.05 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4753  DksA/TraR family DNA-binding protein  50.68 
 
 
243 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000884601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4613  DnaK suppressor protein  50.68 
 
 
243 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000678403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5114  dksa/trar family DNA-binding protein  50.68 
 
 
243 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000229995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4591  DnaK suppressor protein  50.68 
 
 
243 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000615326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.68 
 
 
243 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  50.68 
 
 
243 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.57 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.12 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.73 
 
 
269 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.22 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.66 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.26 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50.72 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.37 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4024  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.05 
 
 
222 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116599  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.38 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577167  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.91 
 
 
228 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.46 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.45 
 
 
121 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0100  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.85 
 
 
130 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1313  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.24 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.29 
 
 
212 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1772  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.36 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000102348  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0687  hypothetical protein  39.47 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.572586  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0424  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.36 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00014325  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1990  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.35 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.4478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1858  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.43 
 
 
206 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.663069  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0744  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.55 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.186685  normal  0.0218217 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1886  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.36 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271081  decreased coverage  0.00232468 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.49 
 
 
216 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1363  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29 
 
 
205 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000285999  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0524  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.35 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2286  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.34 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000387566  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.6 
 
 
213 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.13 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1511  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.27 
 
 
111 aa  53.9  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2904  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.78 
 
 
117 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000908818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.29 
 
 
210 aa  52.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3842  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.9 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209234  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.04 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.05 
 
 
234 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4387  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 
256 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1511  hypothetical protein  39.29 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0964  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.67 
 
 
147 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.633657  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0973  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 
121 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492217  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6194  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.18 
 
 
126 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643826  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.2 
 
 
297 aa  51.2  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  40.28 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.28 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3641  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.78 
 
 
130 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4116  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.78 
 
 
130 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.46 
 
 
275 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1126  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.13 
 
 
231 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00340237  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1292  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.38 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359698  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2439  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.37 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.734932  normal  0.693819 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.9 
 
 
207 aa  49.7  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2047  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.88 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.18 
 
 
527 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.99 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.62 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  31.19 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  39.29 
 
 
283 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3508  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.94 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1799  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.71 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.392784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.9 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.14 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22720  DnaK suppressor protein  35.58 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.432466  normal  0.0927989 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.73 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4148  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.67 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4218  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.67 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419171  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3299  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.67 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322172  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5647  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.1 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0910  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.23 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1198  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114031  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  37 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  34.69 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.05 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.23 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  34.02 
 
 
138 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1158  hypothetical protein  40.3 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2010  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  53.66 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.02 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0141  DNAK suppressor protein  25.26 
 
 
259 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.130476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.99 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.11 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1823  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.64 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00591197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  32.99 
 
 
133 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2396  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0818179  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0188  hypothetical protein  47.06 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3132  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.74 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1452  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.66 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0860961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1418  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.45 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0975581 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>