192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3132 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3132  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 
113 aa  220  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3488  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.75 
 
 
115 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3640  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56.48 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3572  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56.48 
 
 
115 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131957  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1452  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.14 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0860961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2439  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.04 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.734932  normal  0.693819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.45 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.45 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  30.97 
 
 
243 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  31.19 
 
 
243 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.34 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.34 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.76 
 
 
257 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.17 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4971  DNA binding protein, DksA/TraR family  31.19 
 
 
243 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0687  hypothetical protein  28.44 
 
 
134 aa  52  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.572586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.54 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.04 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.54 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.03 
 
 
243 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  29.82 
 
 
243 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.62 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  30.28 
 
 
243 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  43.55 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4753  DksA/TraR family DNA-binding protein  30.28 
 
 
243 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000884601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4591  DnaK suppressor protein  30.28 
 
 
243 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000615326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4613  DnaK suppressor protein  30.28 
 
 
243 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000678403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5114  dksa/trar family DNA-binding protein  30.28 
 
 
243 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000229995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.14 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.69 
 
 
253 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.28 
 
 
243 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  43.55 
 
 
138 aa  50.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  27.27 
 
 
117 aa  50.4  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.69 
 
 
213 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.62 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  34.62 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.38 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 
527 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  28.71 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.24 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3895  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.98 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0249902  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0547  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.73 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5647  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.78 
 
 
269 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.29 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.32 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  33.65 
 
 
158 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0141  DNAK suppressor protein  38 
 
 
259 aa  47.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.130476 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.65 
 
 
158 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0429  hypothetical protein  41.3 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.3 
 
 
176 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.77 
 
 
118 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1313  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.07 
 
 
130 aa  47  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2611  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.1 
 
 
120 aa  47.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1192  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.65 
 
 
158 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1632  TraR/DksA family transcriptional regulator  37 
 
 
114 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  35.06 
 
 
118 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  31.25 
 
 
236 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  33.33 
 
 
283 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  29.29 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0676  hypothetical protein  36 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3101  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.11 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.19 
 
 
159 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2047  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.57 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3508  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.98 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.04 
 
 
146 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.65 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73020  DksA/TraR family C4-type zinc finger protein  36.46 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450272  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.05 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.32 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.27 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.28 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.94 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.02 
 
 
228 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0036  dnaK suppressor protein  29.63 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.86 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.27 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  38.89 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.45 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1754  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.3 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000650821  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.75 
 
 
207 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0064  DnaK suppressor protein  27.78 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0249  TraR/DksA family transcriptional regulator  30 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.534414  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.29 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.05 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.81 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6338  RNA polymerase-binding protein DksA  44.07 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  41.94 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.94 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  37.31 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0680  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.93 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0997736  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3095  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.29 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000335768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.31 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  38.71 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.31 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0401  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.06 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000019993  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  33.64 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.86 
 
 
275 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.71 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>