217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0429 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0429  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  254  4e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0141  DNAK suppressor protein  51.3 
 
 
259 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.130476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5647  transcriptional regulator, TraR/DksA family  49.14 
 
 
128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0419  DnaK suppressor protein  47.11 
 
 
126 aa  103  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.145678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3508  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.64 
 
 
127 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0397  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.38 
 
 
348 aa  100  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_002950  PG1597  DnaK suppressor protein, putative  44.07 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02485  DnaK suppressor protein, putative  41.67 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.130728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0583  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.69 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0703  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.74 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383815  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2047  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.97 
 
 
149 aa  84  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0524  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114279  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1990  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.65 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.4478  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1772  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.71 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000102348  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1886  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.69 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271081  decreased coverage  0.00232468 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0424  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.69 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00014325  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.69 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577167  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2286  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.58 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000387566  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1452  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.46 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0860961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2904  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.78 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000908818  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.38 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0138  putative dnaK suppressor protein  33.62 
 
 
120 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0160  dnaK suppressor protein, putative  33.62 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.532233  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0120  dnaK suppressor protein, putative  32.76 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0934145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1063  DnaK suppressor protein  29.06 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00483953  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.28 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.03 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2439  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.734932  normal  0.693819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3101  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.55 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.81 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.91 
 
 
158 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.96 
 
 
138 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.05 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.1 
 
 
118 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.55 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.96 
 
 
159 aa  50.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.1 
 
 
118 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.83 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.55 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.55 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  44.83 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  43.1 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2533  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.85 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0895997  normal  0.563175 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  46.55 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.55 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 
297 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  46.55 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.81 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.81 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3208  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.64 
 
 
218 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000145805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  46.55 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.83 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  46.55 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  43.1 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.83 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  34.69 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.1 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.5 
 
 
213 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.55 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.55 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.69 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  34.91 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1192  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.69 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.1 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.83 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  35.09 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3262  dnaK suppressor protein, putative  29.03 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2396  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.77 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0818179  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0724  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.38 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0547  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.65 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  27.93 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1939  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.17 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082918 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1292  transcriptional regulator, TraR/DksA family  25.58 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359698  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.11 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  27.93 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.1 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0534  zinc finger DksA/TraR C4-type  28.33 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2611  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.93 
 
 
120 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.67 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0486  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.92 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.1 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.09 
 
 
162 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3132  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.3 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1823  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.71 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00591197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.48 
 
 
121 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  36.67 
 
 
117 aa  47  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.35 
 
 
132 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.87 
 
 
139 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  31.87 
 
 
139 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3487  dnaK suppressor protein, putative  33.7 
 
 
134 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  39.66 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.38 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.38 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  44 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0008  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.21 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0752856 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1290  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.7 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.87 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.33 
 
 
207 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  35.71 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  35.79 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>