More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0687 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0687  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  276  5e-74  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.572586  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.1 
 
 
207 aa  87.8  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.96 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.64 
 
 
297 aa  77.8  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2047  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.62 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4753  DksA/TraR family DNA-binding protein  37.72 
 
 
243 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000884601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4591  DnaK suppressor protein  37.72 
 
 
243 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000615326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4613  DnaK suppressor protein  37.72 
 
 
243 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000678403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5114  dksa/trar family DNA-binding protein  37.72 
 
 
243 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000229995  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.93 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  38.6 
 
 
243 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1886  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.71 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271081  decreased coverage  0.00232468 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  37.72 
 
 
243 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4971  DNA binding protein, DksA/TraR family  37.72 
 
 
243 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.65 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  36.84 
 
 
243 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.51 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.15 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  35.96 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.72 
 
 
243 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2904  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.58 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000908818  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.62 
 
 
146 aa  70.1  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577167  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  33.07 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2286  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.82 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000387566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.09 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0724  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.71 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1990  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.82 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.4478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  36.36 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0524  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.62 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  36 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.88 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1950  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.06 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  44.44 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1772  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.93 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000102348  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  35.59 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.59 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0424  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.93 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00014325  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.55 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  34.55 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1192  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.59 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1452  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.36 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0860961  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.2 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  43.06 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.28 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 
228 aa  67  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.21 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.3 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  31.3 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.07 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.67 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3101  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.66 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.28 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.02 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  39.74 
 
 
283 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0547  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.97 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  40.28 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3085  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.3 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.64 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.06 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.04 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.25 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0046  putative DNAK suppressor protein  32.76 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.25 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.6 
 
 
269 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.75 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.67 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.59 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1313  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.84 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  37.5 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  31.82 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.82 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.1 
 
 
253 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.99 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.26 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0906  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.57 
 
 
207 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.71 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.45 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1457  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.03 
 
 
164 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.3 
 
 
257 aa  61.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.28 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1232  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.11 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.182051 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2340  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.78 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.45 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3255  DnaK suppressor protein  30.43 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.28 
 
 
212 aa  60.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0192  RNA polymerase-binding protein DksA  30.43 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2037  regulator RpoS  34.78 
 
 
146 aa  60.8  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.555499  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22720  DnaK suppressor protein  31.09 
 
 
153 aa  60.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.432466  normal  0.0927989 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0387  DnaK suppressor protein  30.43 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3431  RNA polymerase-binding protein DksA  30.43 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0166  DnaK suppressor protein  30.43 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0203  RNA polymerase-binding protein DksA  30.43 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.23 
 
 
234 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2172  DnaK suppressor protein  30.43 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297381  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2917  RNA polymerase-binding protein DksA  30.43 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123295  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3704  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.17 
 
 
223 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>