190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3842 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3842  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 		 126 aa  246  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6194  transcriptional regulator, TraR/DksA family  72.22 
 
 		 126 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1313  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0064  DnaK suppressor protein  44.93 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0036  dnaK suppressor protein  48.08 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2533  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0895997  normal  0.563175 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4246  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.84 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  34.96 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1950  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.75 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.75 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.4 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1292  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.97 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359698  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.51 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.32 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 158 aa  52  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.3 
 
 		 253 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  37.38 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 243 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.63 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  36.45 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  36.04 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_002620  TC0687  hypothetical protein  53.19 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.572586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.38 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  35.16 
 
 		 243 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  31.78 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  37.78 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.71 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.06 
 
 		 269 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.89 
 
 		 213 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.98 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  31.78 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  32.97 
 
 		 243 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  33.64 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  37.68 
 
 		 243 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.64 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 243 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4971  DNA binding protein, DksA/TraR family  36.23 
 
 		 243 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1511  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.33 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4753  DksA/TraR family DNA-binding protein  31.87 
 
 		 243 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000884601  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1243  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5114  dksa/trar family DNA-binding protein  31.87 
 
 		 243 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000229995  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.84 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  36.23 
 
 		 243 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.16 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4591  DnaK suppressor protein  31.87 
 
 		 243 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000615326  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.64 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4613  DnaK suppressor protein  31.87 
 
 		 243 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000678403  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3381  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.9 
 
 		 223 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0046  putative DNAK suppressor protein  31.9 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.45 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0724  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1772  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.03 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000102348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  42.86 
 
 		 283 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0152  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.89 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3704  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.9 
 
 		 223 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1094  dnaK suppressor protein, putative  50 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.360661  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1886  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.89 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271081  decreased coverage  0.00232468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3835  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.827568 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0524  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114279  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.09 
 
 		 207 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1452  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.18 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0860961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2047  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.5 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0744  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.11 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.186685  normal  0.0218217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0906  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.82 
 
 		 207 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  32.38 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0424  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00014325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 251 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3640  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.48 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1990  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.4478  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.17 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 257 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2904  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000908818  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  41.82 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3572  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.29 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131957  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1597  DnaK suppressor protein, putative  47.62 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0166  DnaK suppressor protein  41.82 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>