85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1511 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1511  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 		 111 aa  216  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.38 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  56 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  56 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  54 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  56 
 
 		 243 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4753  DksA/TraR family DNA-binding protein  54 
 
 		 243 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000884601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4613  DnaK suppressor protein  54 
 
 		 243 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000678403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5114  dksa/trar family DNA-binding protein  54 
 
 		 243 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000229995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  54 
 
 		 243 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4591  DnaK suppressor protein  54 
 
 		 243 aa  60.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000615326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4971  DNA binding protein, DksA/TraR family  54 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4537  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4246  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.27 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0680  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0997736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1313  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.32 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6338  RNA polymerase-binding protein DksA  37.86 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6194  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.45 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22970  RNA polymerase-binding DksA like protein  35.92 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  52 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1418  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0975581 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1452  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.07 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0860961  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73020  DksA/TraR family C4-type zinc finger protein  34.91 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2047  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.65 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3842  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.64 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2904  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000908818  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2439  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.734932  normal  0.693819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  51.02 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2595  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.73 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0744  transcriptional regulator, TraR/DksA family  49.06 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.186685  normal  0.0218217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  36 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.86 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  39.13 
 
 		 283 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  35.71 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  38.57 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.74 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.28 
 
 		 253 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2860  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1858  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.663069  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0524  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114279  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1772  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.5 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000102348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 251 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.91 
 
 		 213 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0424  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00014325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.46 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2286  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.25 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000387566  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4453  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.142377 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0973  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.48 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492217  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1990  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.4478  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1158  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3132  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1926  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.73 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.67 
 
 		 228 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1886  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.5 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271081  decreased coverage  0.00232468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0910  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.33 
 
 		 136 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.68 
 
 		 133 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.23 
 
 		 155 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.27 
 
 		 269 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.78 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.455354  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  42.86 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  40.32 
 
 		 236 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.66 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 158 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  47.83 
 
 		 158 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0429  hypothetical protein  29.81 
 
 		 128 aa  40.4  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1094  dnaK suppressor protein, putative  38.18 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.360661  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3682  transcriptional regulator, TraR/DksA family  57.14 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.594064 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0486  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.43 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  44.44 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>