147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1766 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1846  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 
130 aa  259  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2110  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 
130 aa  259  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1766  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 
130 aa  259  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3066  TraR/DksA family transcriptional regulator  73.64 
 
 
130 aa  193  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.446011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.61 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.61 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.61 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.75 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.7 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2884  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.7 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.17875  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3338  RNA polymerase-binding transcription factor  33.9 
 
 
151 aa  53.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000258197  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3468  RNA polymerase-binding transcription factor  33.9 
 
 
151 aa  53.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0312993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1005  RNA polymerase-binding transcription factor  33.9 
 
 
182 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132792  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1023  DnaK suppressor protein  32.2 
 
 
136 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2698  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.33 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3170  RNA polymerase-binding, DksA  31.9 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000043315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3937  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.03 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000139541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.51 
 
 
228 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.82 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.414377  normal  0.0706919 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1164  RNA polymerase-binding transcription factor  33.05 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00894629  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3114  RNA polymerase-binding transcription factor  33.05 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0231493  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3404  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.9 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000437132  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0180  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.13 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000132063  normal  0.0556483 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0939  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.84 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00144  DNA-binding transcriptional regulator of rRNA transcription, DnaK suppressor protein  33.05 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3457  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.05 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.78 
 
 
257 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0154  RNA polymerase-binding transcription factor  33.05 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1184  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.04 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0148  RNA polymerase-binding transcription factor  33.05 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000273463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0149  RNA polymerase-binding transcription factor  33.05 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3514  RNA polymerase-binding transcription factor  33.05 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000935377  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0156  RNA polymerase-binding transcription factor  33.05 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000187582  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00143  hypothetical protein  33.05 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000224196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0136  RNA polymerase-binding transcription factor  33.05 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000300013  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2340  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.89 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002565  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  45.1 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03446  hypothetical protein  45.1 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2037  regulator RpoS  39.62 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.555499  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0685  RNA polymerase-binding transcription factor  43.4 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0013378  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0874  DnaK suppressor protein  31.9 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0730  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.9 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697807  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3292  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.9 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000329302  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0872  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.9 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000169398  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3490  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.9 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3128  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.9 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000188351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0849  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.9 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000107681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0884  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.9 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000326518  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6338  RNA polymerase-binding protein DksA  42.86 
 
 
134 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3985  RNA polymerase-binding transcription factor  43.4 
 
 
151 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000239354  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4691  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.33 
 
 
147 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000577976 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3276  transcriptional regulators, TraR/DksA family protein  31.36 
 
 
147 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000078623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73020  DksA/TraR family C4-type zinc finger protein  41.27 
 
 
134 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450272  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0584  RNA polymerase-binding dnaK suppressor protein DksA  40.74 
 
 
148 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0202  RNA polymerase-binding transcription factor  43.4 
 
 
151 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210967  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0220  RNA polymerase-binding transcription factor  43.4 
 
 
151 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000337551  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1032  RNA polymerase-binding transcription factor  33.05 
 
 
151 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0218805  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0214  RNA polymerase-binding transcription factor  43.4 
 
 
151 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.748319  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0218  RNA polymerase-binding transcription factor  43.4 
 
 
151 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.236664  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.17 
 
 
144 aa  47  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0203  RNA polymerase-binding transcription factor  43.4 
 
 
151 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0227  DnaK suppressor protein DksA  31.36 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.143062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.4 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  42.03 
 
 
283 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3129  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.51 
 
 
147 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  38 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0741  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.67 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000053151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.59 
 
 
275 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4693  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  36.67 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000772708 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2286  hypothetical protein  43.4 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2259  hypothetical protein  43.4 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0691  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.81 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0872386  normal  0.218793 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2552  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.65 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0402144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1363  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.18 
 
 
205 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000285999  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0780  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.18 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00166659  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0674  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.84 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 
234 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0127  dnaK suppressor protein  43.14 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000295735  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.67 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195272  hitchhiker  0.00000457182 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.06 
 
 
210 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1754  TraR/DksA family transcriptional regulator  31 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000650821  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3899  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.9 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000283088  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03545  putative DnaK suppressor protein  41.18 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000789924  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1977  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.26 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4306  DnaK suppressor protein  43.14 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2707  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.36 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0249  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.14 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.534414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1413  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.33 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3798  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.03 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000388201  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  43.75 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3372  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.93 
 
 
145 aa  44.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.911345  normal  0.0274052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0995  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.09 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0167  putative DnaK suppressor  40.82 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000243735  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1063  DnaK suppressor protein  31.25 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00483953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0698  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.18 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370209  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  33.8 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2819  RNA polymerase-binding transcription factor  31.36 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.02941  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0114  RNA polymerase-binding protein DksA  27.97 
 
 
147 aa  43.5  0.0009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000001721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  27.59 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>