132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6416 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6416  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 		 120 aa  236  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0580522  hitchhiker  0.0061347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1324  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2535  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.15 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  40.19 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2631  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.39 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0800447  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0419  DnaK suppressor protein  30.36 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.145678 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  28.57 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.32 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0691  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0872386  normal  0.218793 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.95 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  39.74 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0138  putative dnaK suppressor protein  28.23 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0120  dnaK suppressor protein, putative  28.23 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0934145  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0160  dnaK suppressor protein, putative  28.23 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.532233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.46 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0534  zinc finger DksA/TraR C4-type  34.21 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781364  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1632  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1267  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 258 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  35.14 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  39.44 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2552  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0402144  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2444  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.414377  normal  0.0706919 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0401  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.01 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000019993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2860  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.83 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  36.45 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0025  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.795475  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.81 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2884  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.62 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.17875  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000740961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0648  putative DnaK suppressor protein  42.19 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0674  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  30 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.7 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0429  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.62 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.51 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000137678  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1158  hypothetical protein  48.15 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0162  DnaK suppressor protein  30.3 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225781  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2310  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  42 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  43.48 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1597  DnaK suppressor protein, putative  28.07 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0693  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.89 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0604  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0114  RNA polymerase-binding protein DksA  39.68 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000001721  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.73 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  50 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.48 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.27 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.9 
 
 		 228 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0180  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000132063  normal  0.0556483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  34.86 
 
 		 129 aa  44.3  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2396  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.3 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0818179  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5647  transcriptional regulator, TraR/DksA family  25 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  31.75 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1418  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0975581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0910  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.83 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1452  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.73 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0860961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1823  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.3 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00591197 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0879  suppressor protein DksA  34.23 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 257 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3682  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.71 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.594064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  31.19 
 
 		 283 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  44.44 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1184  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1290  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1754  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000650821  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2068  DnaK suppressor protein  42.11 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000191774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0939  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.82 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2286  hypothetical protein  35.21 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2259  hypothetical protein  35.21 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0036  dnaK suppressor protein  35 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3488  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3060  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0497831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2904  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000908818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.67 
 
 		 213 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 158 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3620  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.34 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640003  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0249  TraR/DksA family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 122 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.534414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0584  RNA polymerase-binding dnaK suppressor protein DksA  32.88 
 
 		 148 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1154  DnaK suppressor protein-like protein  36.04 
 
 		 122 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3552  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.34 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.578946  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.51 
 
 		 154 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  36.51 
 
 		 154 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1063  DnaK suppressor protein  41.18 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00483953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1980  dnaK suppressor  32.56 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0995  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2623  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0172808  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2698  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0227937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>