More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0162 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0162  DnaK suppressor protein  100 
 
 
137 aa  283  5.999999999999999e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225781  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.67 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.17 
 
 
138 aa  80.1  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  37.12 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  37.5 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.02 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0064  DnaK suppressor protein  32.56 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  37.5 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0036  dnaK suppressor protein  32.56 
 
 
152 aa  77  0.00000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.36 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.83 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  37.5 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.7 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.44 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  36.67 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  30 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.83 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  29.79 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.83 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6338  RNA polymerase-binding protein DksA  36.72 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1950  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.17 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0906  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.71 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  35.83 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.83 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.83 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2533  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0895997  normal  0.563175 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.37 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0808  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.89 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  29.92 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.83 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.92 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.67 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  31.67 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.2 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.23 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1192  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.92 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3704  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1064  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.55 
 
 
450 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.83 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3381  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0509  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.61 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0547  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.33 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.62 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2993  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.89 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73020  DksA/TraR family C4-type zinc finger protein  49.18 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450272  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3683  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.26 
 
 
281 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3438  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.5 
 
 
429 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.17 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22970  RNA polymerase-binding DksA like protein  33.61 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.17 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0046  putative DNAK suppressor protein  30.83 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.2 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3428  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.08 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.17 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4537  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.83 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1457  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.54 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00359  DnaK supressor  33.06 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131287  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  27.64 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.84 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.27 
 
 
257 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  24.81 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3327  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.46 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.69 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.69 
 
 
229 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.33 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0162  hypothetical protein  28.69 
 
 
228 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2595  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.41 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.2 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0676  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.79 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2172  DnaK suppressor protein  29.51 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297381  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3085  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.51 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2917  RNA polymerase-binding protein DksA  29.51 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3487  dnaK suppressor protein, putative  28.68 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623059  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3255  DnaK suppressor protein  29.51 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0387  DnaK suppressor protein  29.51 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3431  RNA polymerase-binding protein DksA  29.51 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3835  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.89 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.827568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2014  TraR/DksA family transcriptional regulator  27.87 
 
 
162 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0166  DnaK suppressor protein  29.51 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0192  RNA polymerase-binding protein DksA  29.51 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.73 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000137678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0203  RNA polymerase-binding protein DksA  29.51 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.23 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4693  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  30.4 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000772708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3262  dnaK suppressor protein, putative  28.68 
 
 
134 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.4 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195272  hitchhiker  0.00000457182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1844  TraR/DksA family transcriptional regulator  27.13 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0449164  normal  0.0842967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3519  TraR/DksA family transcriptional regulator  27.13 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0696704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.55 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2220  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  27.13 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0071  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.69 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0724  TraR/DksA family transcriptional regulator  26.92 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1094  dnaK suppressor protein, putative  33.94 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.360661  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3452  TraR/DksA family transcriptional regulator  28 
 
 
134 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4379  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.69 
 
 
139 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6440  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.69 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2999  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.69 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.141456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3137  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.69 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3090  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.69 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>