191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6415 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6415  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 
110 aa  223  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143253  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1632  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.62 
 
 
114 aa  99  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.06 
 
 
213 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1511  hypothetical protein  34.96 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.92 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1290  TraR/DksA family transcriptional regulator  38 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2922  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.53 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.319958 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.11 
 
 
253 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.1 
 
 
176 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0100  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.11 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.5 
 
 
269 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1267  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 
258 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120418  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1158  hypothetical protein  48.98 
 
 
124 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.28 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2311  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  36.56 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.87 
 
 
104 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  32.06 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.93 
 
 
216 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2168  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.64 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1094  dnaK suppressor protein, putative  48.89 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.360661  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1418  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.67 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0975581 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  27.18 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2860  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.74 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  27.83 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000740961  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.06 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.68 
 
 
251 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.82 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1823  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.6 
 
 
130 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00591197 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1363  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.93 
 
 
205 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000285999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.27 
 
 
121 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.53 
 
 
212 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29 
 
 
210 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2396  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.6 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0818179  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  46 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2611  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.33 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1282  zinc finger DksA/TraR C4-type  44 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  32.48 
 
 
236 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.45 
 
 
141 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000137678  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.73 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.46 
 
 
121 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0534  zinc finger DksA/TraR C4-type  31.25 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781364  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0025  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.69 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.795475  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  34.52 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  29.17 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.15 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.35 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  41.38 
 
 
283 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2024  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  35.48 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812974  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  32.1 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1419  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  35.48 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597542  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  38 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.31 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2552  TraR/DksA family transcriptional regulator  26.5 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0402144  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.1 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0249  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.85 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.534414  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1047  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  35.48 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1334  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  35.48 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3205  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  35.48 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3077  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  35.48 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2314  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  35.48 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42640  RNA polymerase binding protein DksA  26.47 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.105027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  34.15 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.1 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  25.23 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.18 
 
 
212 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.57 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.53 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  36 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2010  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  37.86 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.1 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  40 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0167  putative DnaK suppressor  37.74 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000243735  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22720  DnaK suppressor protein  34 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.432466  normal  0.0927989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0879  suppressor protein DksA  40.91 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1413  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.94 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 
527 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  36.25 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.72 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.25 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.29 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  36.08 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3327  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.86 
 
 
134 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3060  TraR/DksA family transcriptional regulator  27.17 
 
 
145 aa  43.5  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0497831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0693  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.74 
 
 
130 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1844  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.06 
 
 
134 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0449164  normal  0.0842967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.56 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  28.92 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.5 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.81 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1063  DnaK suppressor protein  30.63 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00483953  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.1 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.45 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.7 
 
 
275 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62490  suppressor protein DksA  25.49 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.1 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5439  suppressor protein DksA  25.49 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>