131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1499 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  100 
 
 		 295 aa  590  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  96.95 
 
 		 295 aa  573  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  94.58 
 
 		 295 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  69.39 
 
 		 296 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  64.48 
 
 		 301 aa  358  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  63.79 
 
 		 301 aa  349  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  50 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  49.01 
 
 		 284 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  48.24 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  49 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  50.18 
 
 		 286 aa  249  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  49.81 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  47.45 
 
 		 284 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  45.79 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  47.83 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  48.02 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  42.91 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.22 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  48.43 
 
 		 282 aa  231  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  46.53 
 
 		 282 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  44.13 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  47.81 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  42.18 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  41.4 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  41.78 
 
 		 294 aa  205  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  40.27 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  40.27 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  40.6 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  39.93 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  40.82 
 
 		 289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  40.34 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  36.01 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  40.24 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.86 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  41.35 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  34.46 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  33.59 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  34.56 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  38.22 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  28.32 
 
 		 274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  28.96 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  30.12 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.19 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  32.55 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  31.69 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  30.58 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  29.9 
 
 		 351 aa  96.3  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  29.41 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  28.33 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  31.01 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  29.89 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.2 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.63 
 
 		 274 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  29.46 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.57 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  27.31 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1620  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.32 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  25.74 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  30.04 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.78 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4076  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.4 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.125935  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22170  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.19 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  23.9 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2849  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.24 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11708  phosphatase  27.07 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.900168  normal  0.127356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.69 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.98 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  25.84 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.74 
 
 		 264 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931975  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3498  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.22 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.622356  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  29.72 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3292  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  25.97 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4443  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIA  29.62 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.198933  normal  0.115883 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  29.15 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.89 
 
 		 675 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  27.94 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  27.94 
 
 		 259 aa  50.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2607  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.52 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3163  HAD family hydrolase  29.37 
 
 		 449 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0117236  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  26.59 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2953  HAD family hydrolase  27.2 
 
 		 334 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.361868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2997  HAD family hydrolase  27.2 
 
 		 334 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411928  normal  0.553212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  28.06 
 
 		 333 aa  48.9  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1749  HAD family hydrolase  29.5 
 
 		 366 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0343675  hitchhiker  0.000628636 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  27.95 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2968  HAD family hydrolase  26.4 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  25.87 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1338  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.46 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3034  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.56 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1655  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.77 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0557426  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0892  HAD superfamily hydrolase  25.9 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.65538  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  27.14 
 
 		 338 aa  47  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0678  HAD hydrolase, family IIA  24.66 
 
 		 366 aa  47  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25490  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  27.03 
 
 		 336 aa  45.8  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4827  phosphatase  25.2 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00162438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5192  phosphatase  25.2 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.183726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3511  HAD family hydrolase  25.79 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540896  normal  0.0582396 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>