214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2153 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  100 
 
 		 281 aa  566  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  45.88 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  46.04 
 
 		 279 aa  211  7e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  44.57 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  41.73 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  39.36 
 
 		 278 aa  148  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  35.36 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  33.45 
 
 		 295 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  32.54 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  35.06 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  32.63 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  34.39 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  34.4 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  33.57 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  34.87 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  32.76 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  28.96 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.96 
 
 		 295 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  32.37 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.29 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  29.33 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  32.95 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  31.01 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.62 
 
 		 284 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  30.85 
 
 		 283 aa  108  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  32.89 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  30.87 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  32.67 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  33.82 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  30.23 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.95 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.35 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.56 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.76 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  28.08 
 
 		 282 aa  99.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  29.62 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  30.62 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  29.32 
 
 		 351 aa  97.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  30.89 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  29.84 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  29.15 
 
 		 297 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  31.8 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  29.12 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  28.79 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  28.91 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  31.1 
 
 		 299 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  32.17 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  29.39 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  27.24 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  30.39 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  28.42 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  28.03 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0324  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  29.81 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.984086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  29.92 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.76 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0653  HAD family hydrolase  29.39 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.451378  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.36 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.83 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  30.98 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  25.44 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.56 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1911  HAD-superfamily hydrolase  28.12 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.22 
 
 		 675 aa  65.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  29.11 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  29.69 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2757  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.91 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0515  HAD family hydrolase  28.34 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.18 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.029851  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0656  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.02 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0281  HAD family hydrolase  31.22 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  28.79 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  27.99 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1837  phosphoglycolate phosphatase  25.84 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1760  HAD family hydrolase  28.63 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0798453  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0846  HAD family hydrolase  25.48 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578477  normal  0.241059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0990  HAD family hydrolase  25.48 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.383042  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.73 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.28866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3145  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.63 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2187  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.04 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0794654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.82 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1914  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.5 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00534341  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3292  HAD family hydrolase  26.53 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0563  HAD family hydrolase  26.75 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0984026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  27.46 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3248  HAD family hydrolase  26.19 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1338  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.36 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3022  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.446988  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.64 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0544  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.27 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  28.51 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2722  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.02 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2752  phosphoglycolate phosphatase  26.52 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0283  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  29.24 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0142  HAD family hydrolase  27.05 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0794  HAD family hydrolase  28.69 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15000  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.28 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.039649  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0043  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  26.25 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.58574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>