143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4280 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  100 
 
 		 296 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  69.73 
 
 		 295 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  69.39 
 
 		 295 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  70 
 
 		 295 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  66.44 
 
 		 301 aa  359  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  67.92 
 
 		 301 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  53.24 
 
 		 300 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  50 
 
 		 283 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  50.34 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  47.22 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  51.97 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  49.8 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  47.72 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  50.2 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  46.69 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  48.41 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  48.41 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  49.24 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  45.14 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  47.79 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  48.22 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  44.91 
 
 		 282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  43.54 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  41.08 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  44.91 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  43 
 
 		 289 aa  205  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  48.03 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  43.94 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  42.28 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  40.4 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  40.4 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  45.9 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  43.59 
 
 		 284 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  39.02 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  38.16 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  35.86 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.33 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  37.22 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  38.8 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.97 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  39.51 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  33.59 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  29.01 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  38.34 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  32.61 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  32.67 
 
 		 281 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  29.17 
 
 		 351 aa  95.9  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  31.12 
 
 		 268 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  27.96 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  28.15 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  32.94 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  32.55 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  30.45 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.47 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  31.09 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.96 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  26.81 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  32.81 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2849  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.74 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.66 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  27.98 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  27.08 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.97 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11708  phosphatase  28.08 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.900168  normal  0.127356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  31.06 
 
 		 338 aa  54.3  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.08 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.02 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2038  HAD family hydrolase  32.54 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04360  4-nitrophenylphosphatase, putative  35.35 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  26.77 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1620  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.05 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  28.96 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2953  HAD family hydrolase  27.38 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.361868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2997  HAD family hydrolase  27.38 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411928  normal  0.553212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4076  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.35 
 
 		 366 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.125935  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.36 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  26.75 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2912  UMP phosphatase  26.86 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141408  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3000  UMP phosphatase  26.86 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0137  phosphatase,haloacid dehalogenase family  25.98 
 
 		 254 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.651243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3292  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 337 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0678  HAD family hydrolase  28.91 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000169534  hitchhiker  0.0000480056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5096  phosphatase  25.54 
 
 		 254 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.344211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4668  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  25.54 
 
 		 254 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265618  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5101  phosphatase,haloacid dehalogenase family  25.54 
 
 		 254 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.348234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  32.33 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1338  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.98 
 
 		 338 aa  49.3  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5063  phosphatase,haloacid dehalogenase family  25.54 
 
 		 254 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4827  phosphatase  25.54 
 
 		 254 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00162438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4685  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  25.39 
 
 		 254 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5192  phosphatase  25.54 
 
 		 254 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.183726  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2968  HAD family hydrolase  28.69 
 
 		 334 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22170  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.29 
 
 		 345 aa  49.3  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.77 
 
 		 342 aa  49.3  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1514  HAD family hydrolase  27.95 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  28.92 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  26.75 
 
 		 259 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2722  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.73 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25490  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.63 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0800  putative HAD superfamily sugar phosphatase  29.28 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>