249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0854 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 		 306 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  45.95 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  39.46 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  39.15 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1362  hypothetical protein  38.97 
 
 		 243 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  29.93 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  28.41 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  32.65 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  30.11 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0794  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  31.97 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3145  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.96 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  32.3 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35270  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  27 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  27.21 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3643  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.52 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3248  HAD family hydrolase  28.74 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1760  HAD family hydrolase  28.82 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0798453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2194  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.74 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2424  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.19 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.22995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  31.33 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2196  HAD family hydrolase  27.7 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  30.55 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3022  HAD family hydrolase  28.12 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.446988  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1975  HAD family hydrolase  28.25 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2021  HAD family hydrolase  28.25 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15000  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.05 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.039649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3221  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.05 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  27.41 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0515  HAD family hydrolase  24.49 
 
 		 276 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  31.02 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1242  HAD family hydrolase  28.92 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1955  HAD family hydrolase  27.88 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.46 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  28.4 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  30.71 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33094  predicted protein  26.95 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4181  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.71 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.646523  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4163  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.78 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.81021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2419  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  27.87 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1911  HAD-superfamily hydrolase  28.19 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  30.33 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.92 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.01 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0324  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  29.83 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.984086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.61 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2757  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.95 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  24.9 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0656  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.54 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.84 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  30.74 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  30.92 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  25.56 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0678  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.43 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0281  HAD family hydrolase  28.84 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.44 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  31.27 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  28.51 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  26.16 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0089  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.8 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  26.61 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1514  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2555  HAD family hydrolase  29.43 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0682224  normal  0.0129404 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0233  HAD family hydrolase  22.85 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.17 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  28.85 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2968  HAD family hydrolase  32.11 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0839  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.67 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  26.69 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  27.38 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.71 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.28866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4736  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.19 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.78 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  23.25 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  29.07 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  27.78 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04360  4-nitrophenylphosphatase, putative  23.16 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  23.25 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0043  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  28.51 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.58574  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  27.2 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  28.28 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59523  p-Nitrophenyl phosphatase  23.73 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.400551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.91 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1790  HAD family hydrolase  25.09 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0846  HAD family hydrolase  24.91 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578477  normal  0.241059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0990  HAD family hydrolase  24.91 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.383042  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  27.91 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0317  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.09 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.937319  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  29.07 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  31.78 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3889  HAD family hydrolase  26.72 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2752  phosphoglycolate phosphatase  27.34 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  26.59 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  28.28 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  26.26 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2953  HAD family hydrolase  31.3 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.361868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>