190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1795 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  100 
 
 		 304 aa  600  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  34.23 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  36.16 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  39.27 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  33.58 
 
 		 278 aa  93.2  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  25.9 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1362  hypothetical protein  36.49 
 
 		 243 aa  92.4  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  32.4 
 
 		 280 aa  87  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  28.67 
 
 		 282 aa  86.3  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  31.8 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  32.17 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.81 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  28.91 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  29.75 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  29.59 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  32.34 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  31.27 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  29.59 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.35 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  31.06 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  27.8 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  27.13 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  28.52 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  29.09 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  29.59 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  30.68 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  30.22 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  30.68 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  29.62 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  31.91 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22170  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  30.6 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.92 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  29.05 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  30.21 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  32.4 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  30.45 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  31.5 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.1 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  29.59 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  28.68 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.35 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2555  HAD family hydrolase  31.73 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0682224  normal  0.0129404 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07430  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  29.83 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  31.46 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1514  HAD family hydrolase  30.04 
 
 		 330 aa  68.9  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  30.12 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  29.85 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  25.45 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.78 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1338  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.76 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  29.57 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0137  phosphatase,haloacid dehalogenase family  26.15 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.651243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2038  HAD family hydrolase  29.78 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  28.63 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5096  phosphatase  26.15 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.344211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5101  phosphatase,haloacid dehalogenase family  26.15 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.348234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4827  phosphatase  26.15 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00162438  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4668  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  26.15 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4685  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  26.15 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5192  phosphatase  26.15 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.183726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.57 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  30.11 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5063  phosphatase,haloacid dehalogenase family  26.15 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2968  HAD family hydrolase  28.95 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  27.34 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4780  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  29.46 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25490  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.21 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  28.93 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  28.79 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  29.12 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04360  4-nitrophenylphosphatase, putative  25.62 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2953  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.361868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2997  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411928  normal  0.553212 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  26.67 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.66 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.46 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.93 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  26.55 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1898  HAD family hydrolase  28.87 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214064 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  25.58 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5102  phosphatase,haloacid dehalogenase family  25.77 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  27.21 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  33.33 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931975  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3015  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.94 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2419  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  28.09 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.46 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  27.7 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1907  HAD family hydrolase  28.84 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.1 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  23.95 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0317  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  22.61 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.937319  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  23.95 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.44 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  25.77 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.72 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3163  HAD family hydrolase  28.68 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0117236  normal  0.303399 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>