162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2225 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  100 
 
 		 301 aa  584  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  79.4 
 
 		 301 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  68.79 
 
 		 296 aa  378  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  65.52 
 
 		 295 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  64.14 
 
 		 295 aa  363  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  63.79 
 
 		 295 aa  360  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  51.68 
 
 		 300 aa  279  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  50 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  49.65 
 
 		 284 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  50.35 
 
 		 284 aa  262  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  50.86 
 
 		 286 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  49.31 
 
 		 284 aa  258  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  49.1 
 
 		 283 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  49.8 
 
 		 284 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  49.8 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  49.21 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  51.57 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  51 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  45.07 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.65 
 
 		 282 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  45.91 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  44.93 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  50.79 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  46.57 
 
 		 282 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  49.61 
 
 		 290 aa  226  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  41.86 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  41.53 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  48.47 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  39.87 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  41.55 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  38.1 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  42.74 
 
 		 281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  44.4 
 
 		 283 aa  175  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.1 
 
 		 290 aa  175  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  41.89 
 
 		 284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  35.81 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  36.25 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  37.02 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  41.63 
 
 		 280 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  39.27 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  28.14 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  33.08 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  40.08 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  33.22 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  33.72 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  34.84 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  31.32 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  33.45 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  32.06 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  29.71 
 
 		 351 aa  93.2  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  28.48 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  28.22 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.97 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  30.65 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  30.72 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.6 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.03 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  30.83 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.76 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  29.13 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  28.4 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2849  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.05 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2038  HAD family hydrolase  29.8 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  28.68 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1620  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.87 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  28.52 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4685  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  27.24 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5063  phosphatase,haloacid dehalogenase family  27.34 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5096  phosphatase  27.34 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.344211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4668  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  27.34 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0137  phosphatase,haloacid dehalogenase family  27.34 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.651243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.28 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  28.63 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5101  phosphatase,haloacid dehalogenase family  27.34 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.348234  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.3 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4827  phosphatase  27.34 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00162438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5192  phosphatase  27.34 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.183726  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  23.85 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22170  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.73 
 
 		 345 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1749  HAD family hydrolase  30.27 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0343675  hitchhiker  0.000628636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.01 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5102  phosphatase,haloacid dehalogenase family  26.97 
 
 		 254 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1514  HAD family hydrolase  29.5 
 
 		 330 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2762  UMP phosphatase  25.1 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0512  HAD family hydrolase  30.09 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.425077 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  29.45 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1655  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.08 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0557426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2454  UMP phosphatase  25.81 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.010587  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2547  UMP phosphatase  25.81 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000020241  normal  0.838797 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3557  HAD family hydrolase  24.44 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0800  putative HAD superfamily sugar phosphatase  28.11 
 
 		 346 aa  50.4  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4780  HAD family hydrolase  26.59 
 
 		 254 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3163  HAD family hydrolase  28.91 
 
 		 449 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0117236  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1190  UMP phosphatase  28.28 
 
 		 250 aa  49.7  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114642  hitchhiker  0.000177666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11708  phosphatase  29.37 
 
 		 353 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.900168  normal  0.127356 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2912  UMP phosphatase  27.13 
 
 		 250 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141408  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3000  UMP phosphatase  27.13 
 
 		 250 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161111  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.69 
 
 		 329 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  30.58 
 
 		 255 aa  49.3  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>