156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2194 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  100 
 
 		 297 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  88.89 
 
 		 297 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  88.22 
 
 		 297 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  58.72 
 
 		 289 aa  333  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  54.21 
 
 		 290 aa  319  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  53.54 
 
 		 290 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  52.33 
 
 		 291 aa  297  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  43.54 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  41.72 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  43.54 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  43.2 
 
 		 284 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  40.96 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  42.18 
 
 		 284 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  43.28 
 
 		 284 aa  218  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  40.94 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  45.59 
 
 		 284 aa  215  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  40.54 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  42.16 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  41.47 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  39.19 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  43.45 
 
 		 284 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  39.53 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  41.08 
 
 		 296 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  38.7 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  41.76 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  41.36 
 
 		 295 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  39.93 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  40.34 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  38.72 
 
 		 281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  39.86 
 
 		 299 aa  195  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  40.2 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  40.46 
 
 		 286 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  39.87 
 
 		 301 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  42.11 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  41.55 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  37.41 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  34.78 
 
 		 284 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  32.36 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  32.5 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  32.25 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  32.46 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  31.56 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  29.62 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  36.22 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  30.45 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  32.95 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  31.78 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  27.74 
 
 		 351 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  29.15 
 
 		 281 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  29.59 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.55 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  24.52 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07430  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.95 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.34 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  29.72 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  27.89 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.92 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1898  HAD family hydrolase  29.13 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.59 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  25.56 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  26.24 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  27.55 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.89 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.029851  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  28.69 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.46 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.24 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.57 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  23.69 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1514  HAD family hydrolase  27.6 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  26.51 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1338  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.62 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  28.24 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14240  haloacid dehalogenase subfamily IIA protein  27.71 
 
 		 276 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00966269  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11708  phosphatase  27.52 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.900168  normal  0.127356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  25.55 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2038  HAD family hydrolase  27.68 
 
 		 334 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25490  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  25.56 
 
 		 336 aa  52.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00632  UMP phosphatase  23.14 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000712953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2962  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  23.14 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000529801  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00623  hypothetical protein  23.14 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  23.55 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0719  UMP phosphatase  23.14 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000961731  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0700  UMP phosphatase  23.14 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0766  UMP phosphatase  23.14 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000485352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2981  UMP phosphatase  23.14 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00141438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0695  UMP phosphatase  23.14 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00424094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0576  UMP phosphatase  23.14 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0275278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4076  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.67 
 
 		 366 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.125935  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0800  putative HAD superfamily sugar phosphatase  26.12 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1362  hypothetical protein  44.44 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1888  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.71 
 
 		 286 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.772314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22170  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  27.65 
 
 		 345 aa  49.7  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  25.87 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1907  HAD family hydrolase  26.77 
 
 		 340 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  25.48 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0740  UMP phosphatase  22.44 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  normal  0.752742 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0800  UMP phosphatase  22.44 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0836  UMP phosphatase  22.44 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0728  UMP phosphatase  22.44 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>