142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0896 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  100 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  83.8 
 
 		 284 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  83.1 
 
 		 284 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  82.75 
 
 		 284 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  74.3 
 
 		 284 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  74.3 
 
 		 284 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  70.42 
 
 		 284 aa  428  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  49.6 
 
 		 283 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  48.23 
 
 		 286 aa  255  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  47 
 
 		 300 aa  252  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  48.22 
 
 		 282 aa  250  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  51.33 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  48.08 
 
 		 301 aa  249  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  52.78 
 
 		 282 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  51.6 
 
 		 282 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  49.3 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  46.52 
 
 		 283 aa  245  6.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  50.2 
 
 		 296 aa  244  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  52 
 
 		 282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  49.8 
 
 		 282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  48.37 
 
 		 290 aa  241  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  47.55 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  48.02 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.62 
 
 		 295 aa  235  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.22 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  46.58 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  44.94 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  44.19 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  42.05 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  43.45 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  44.24 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.53 
 
 		 290 aa  199  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  42.8 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  42.48 
 
 		 289 aa  188  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  39.92 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  40 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  40.15 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  36.14 
 
 		 288 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  30.35 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  33.92 
 
 		 280 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  38.7 
 
 		 281 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  32.84 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  35.76 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  36.22 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  35.47 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  33.2 
 
 		 280 aa  112  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  32.95 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  32.2 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  30.19 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  28.01 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  26.42 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  29.12 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  27.16 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.92 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.44 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  30.68 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  26.46 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.1 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  28.85 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.63 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1620  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.16 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  23.44 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.88 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0563  HAD family hydrolase  26.25 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0984026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  29.84 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.83 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2722  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.82 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07430  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.33 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  28.4 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  28.4 
 
 		 336 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  27.64 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55335  p-nitrophenyl phosphatase  23.13 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424742  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0678  HAD family hydrolase  27.73 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000169534  hitchhiker  0.0000480056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1592  HAD family hydrolase  26.4 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  24.28 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  24.28 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14240  haloacid dehalogenase subfamily IIA protein  29.62 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00966269  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  24.05 
 
 		 273 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0142  HAD family hydrolase  24.9 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3022  HAD family hydrolase  26.88 
 
 		 259 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.446988  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  26.94 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2187  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0794654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3321  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.21 
 
 		 278 aa  48.9  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00782584  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.63 
 
 		 329 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.31 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2382  UMP phosphatase  24.58 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0204611  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00632  UMP phosphatase  24.71 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000712953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2962  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.71 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000529801  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00623  hypothetical protein  24.71 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2454  UMP phosphatase  24.58 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.010587  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  25.63 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2547  UMP phosphatase  24.58 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000020241  normal  0.838797 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0719  UMP phosphatase  24.71 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000961731  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0700  UMP phosphatase  24.71 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385389  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3248  HAD family hydrolase  26.25 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2981  UMP phosphatase  24.71 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00141438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0695  UMP phosphatase  24.71 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00424094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0576  UMP phosphatase  24.71 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0275278  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0800  putative HAD superfamily sugar phosphatase  27.13 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0766  UMP phosphatase  24.71 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000485352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>