266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3222 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  577  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  44.57 
 
 		 281 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  42.48 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  41.26 
 
 		 278 aa  182  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  43.37 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  38.16 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  38.28 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  38.58 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  37.33 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  37.85 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  35.97 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  36.36 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  39.11 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  36.14 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  36.14 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  36.05 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  37.67 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  34.69 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  36.71 
 
 		 282 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  34.94 
 
 		 282 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  32.37 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  37.25 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  34.58 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  33.59 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  36.43 
 
 		 301 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  34.7 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  36.03 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  33.91 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  33.59 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  33.2 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  33.22 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  32.53 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  34.78 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  35.43 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  35.05 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  31.33 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  32.44 
 
 		 290 aa  128  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  35.09 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  32.06 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.79 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  34.12 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  31.18 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  29.62 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  29.23 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  35.6 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  28.85 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  33.09 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  28.62 
 
 		 351 aa  93.6  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  29.92 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  30.92 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  29.54 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  31.8 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  33.2 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.56 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0653  HAD family hydrolase  30.17 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.451378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  27.27 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4685  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  29.54 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5063  phosphatase,haloacid dehalogenase family  29.54 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5101  phosphatase,haloacid dehalogenase family  29.54 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.348234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5096  phosphatase  29.54 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.344211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4668  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  29.54 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265618  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0892  HAD superfamily hydrolase  27.09 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.65538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4827  phosphatase  29.11 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00162438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5192  phosphatase  29.11 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.183726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.85 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0137  phosphatase,haloacid dehalogenase family  29.54 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.651243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  28.97 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.14 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5102  phosphatase,haloacid dehalogenase family  29.11 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  26.71 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.65 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3557  HAD family hydrolase  28.27 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4780  HAD family hydrolase  28.69 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3022  HAD family hydrolase  31.71 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.446988  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.56 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.029851  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  29.92 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1620  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.17 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  27.57 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  27.57 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.01 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3248  HAD family hydrolase  31.67 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2752  phosphoglycolate phosphatase  31.13 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0515  HAD family hydrolase  30.12 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0335  UMP phosphatase  29.84 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00626353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  32.78 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2722  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  32.26 
 
 		 267 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0563  HAD family hydrolase  24.9 
 
 		 256 aa  67  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0984026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.39 
 
 		 675 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25490  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  27.56 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2912  UMP phosphatase  29.84 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.34 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3000  UMP phosphatase  29.84 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161111  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  31.54 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1224  UMP phosphatase  31.12 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387552  normal  0.0757281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.98 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2196  HAD family hydrolase  31.4 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2187  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.46 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0794654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>