191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5827 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  579  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  62.54 
 
 		 282 aa  361  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  62.9 
 
 		 282 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  62.54 
 
 		 282 aa  358  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  56.18 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  52.75 
 
 		 282 aa  308  8e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  53.24 
 
 		 286 aa  304  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  53.33 
 
 		 283 aa  302  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  50.55 
 
 		 300 aa  268  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  49.42 
 
 		 284 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  50 
 
 		 296 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  48.25 
 
 		 284 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  49.6 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.33 
 
 		 284 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  46.07 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  48.05 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  45.69 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  44.16 
 
 		 281 aa  245  6e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  49.1 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  45.69 
 
 		 286 aa  242  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  43.88 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  46.21 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  48.21 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  47.81 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.81 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  39.93 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  44.01 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  40.94 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  39.26 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  43.34 
 
 		 289 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  47.66 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  39.93 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  37.98 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.46 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  37.41 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  38.85 
 
 		 284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  36.05 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  35.44 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  28.01 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  36.21 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  30.66 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  29.33 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  30.26 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  28.03 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  34.29 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  26.54 
 
 		 351 aa  102  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  29.58 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  29.58 
 
 		 299 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  31.91 
 
 		 280 aa  99.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  27.12 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  27.17 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.2 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  23.68 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.48 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  25.3 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  30.21 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.82 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  28.34 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.98 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  28.29 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  28.98 
 
 		 336 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  27.92 
 
 		 273 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  24.32 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  25.74 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.09 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0794  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.51 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.64 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.28866  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1760  HAD family hydrolase  27.53 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0798453  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3034  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.71 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.16 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  25 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1898  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  26.03 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0039  HAD family sugar phosphatase  21.49 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0928  HAD family hydrolase  24.7 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0563  HAD family hydrolase  27.97 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0984026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  30.29 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11708  phosphatase  28.91 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.900168  normal  0.127356 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0947  HAD family hydrolase  24.7 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1914  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.16 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00534341  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1224  UMP phosphatase  25.83 
 
 		 250 aa  57  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387552  normal  0.0757281 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  23.79 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3292  HAD family hydrolase  25.3 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0892  HAD superfamily hydrolase  26.07 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.65538  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  25.64 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.41 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0515  HAD superfamily hydrolase  23.6 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25490  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  26.8 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3000  UMP phosphatase  25.83 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161111  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2912  UMP phosphatase  25.83 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141408  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04360  4-nitrophenylphosphatase, putative  23.47 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2038  HAD family hydrolase  25.93 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02970  4-nitrophenylphosphatase (AFU_orthologue; AFUA_3G08310)  26.02 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.509527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1514  HAD family hydrolase  27.59 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  24.29 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1190  UMP phosphatase  23.43 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114642  hitchhiker  0.000177666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22170  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.05 
 
 		 345 aa  53.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2563  HAD family hydrolase  24.63 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>