163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1844 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  100 
 
 
300 aa  606  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  53.24 
 
 
296 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  50 
 
 
286 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  50 
 
 
295 aa  270  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  50.83 
 
 
301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  50.34 
 
 
295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  50 
 
 
295 aa  269  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  50.55 
 
 
283 aa  268  8e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  51.68 
 
 
301 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  50.81 
 
 
282 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  49.47 
 
 
282 aa  265  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  48.67 
 
 
283 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  48.08 
 
 
290 aa  259  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  50 
 
 
286 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  47 
 
 
284 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  46.59 
 
 
284 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  45.94 
 
 
284 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  48.76 
 
 
282 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  46.29 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  43.82 
 
 
284 aa  243  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  45.94 
 
 
284 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  46.13 
 
 
284 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  48.76 
 
 
282 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  48.76 
 
 
282 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  44.07 
 
 
299 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  47.88 
 
 
294 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  42.76 
 
 
281 aa  223  4e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  43.16 
 
 
283 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  41.76 
 
 
297 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  41.76 
 
 
297 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  41.76 
 
 
297 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  40.78 
 
 
289 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  37.55 
 
 
290 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  40.21 
 
 
284 aa  178  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  39.03 
 
 
290 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  38.55 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  37.29 
 
 
295 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  38.28 
 
 
288 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  32.97 
 
 
274 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  36.08 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  36.11 
 
 
280 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  35.34 
 
 
281 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  32.32 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  32.76 
 
 
281 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  32.61 
 
 
278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  27.42 
 
 
294 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  28.53 
 
 
351 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  32.53 
 
 
280 aa  105  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  31.88 
 
 
299 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  32.71 
 
 
299 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  27.65 
 
 
316 aa  89  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.72 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  26.5 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  30.82 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  29.59 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2912  UMP phosphatase  28.98 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141408  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3000  UMP phosphatase  28.98 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.08 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.51 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0335  UMP phosphatase  28.57 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00626353  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  32.64 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
332 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  26.07 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.23 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1190  UMP phosphatase  28.16 
 
 
250 aa  62.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114642  hitchhiker  0.000177666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0740  UMP phosphatase  28.57 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  normal  0.752742 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0800  UMP phosphatase  28.57 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  27.71 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0836  UMP phosphatase  28.57 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0787  UMP phosphatase  28.57 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  0.744456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0728  UMP phosphatase  28.57 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1605  UMP phosphatase  27.73 
 
 
248 aa  60.5  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000109056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.56 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931975  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00632  UMP phosphatase  27.94 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000712953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2962  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.94 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000529801  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0576  UMP phosphatase  27.94 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0275278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00623  hypothetical protein  27.94 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0719  UMP phosphatase  27.94 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000961731  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0700  UMP phosphatase  27.94 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0766  UMP phosphatase  27.94 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000485352  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2981  UMP phosphatase  27.94 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00141438  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0695  UMP phosphatase  27.94 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00424094  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1840  UMP phosphatase  28.39 
 
 
248 aa  59.3  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000453857  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  27.88 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0800  putative HAD superfamily sugar phosphatase  28.69 
 
 
346 aa  58.5  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1224  UMP phosphatase  26.94 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387552  normal  0.0757281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.12 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.43 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.029851  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  26.53 
 
 
257 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1594  UMP phosphatase  25.42 
 
 
248 aa  56.6  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000808476  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3015  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.51 
 
 
359 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2382  UMP phosphatase  25.62 
 
 
248 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0204611  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2762  UMP phosphatase  25.62 
 
 
248 aa  55.8  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2551  UMP phosphatase  26.67 
 
 
248 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000346964  unclonable  0.00000000000937616 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14240  haloacid dehalogenase subfamily IIA protein  31.02 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00966269  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  26.82 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2547  UMP phosphatase  25.62 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000020241  normal  0.838797 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1733  UMP phosphatase  26.67 
 
 
248 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000210359  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1771  UMP phosphatase  26.67 
 
 
248 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000884824  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1338  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.69 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>