158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0681 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  100 
 
 		 294 aa  586  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  52.22 
 
 		 299 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  44.37 
 
 		 300 aa  241  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  45.55 
 
 		 284 aa  241  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  46.92 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  45.89 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  46.92 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  45.89 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  44.86 
 
 		 284 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  44.86 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  43.71 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  44.18 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  43.9 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  44.22 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  43.15 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  42.95 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  42.76 
 
 		 283 aa  218  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  42.12 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  47.66 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  44.59 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  43.75 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  44.93 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  45.52 
 
 		 282 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  39.93 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  39.6 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  46.24 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  39.27 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  38.36 
 
 		 290 aa  201  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  46.59 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  40.68 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  40.69 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  39.57 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  35.03 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.47 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  34.56 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  37.95 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  36.49 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  34.01 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  35.02 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  35.53 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  34.52 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  36.36 
 
 		 279 aa  119  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  29.43 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  34.01 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  34.12 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  27.48 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  29.93 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  29.79 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  29.27 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  31.1 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  32.71 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  25.74 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  29.64 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.72 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  28.24 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  26.89 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  28.03 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.28 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.39 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  22.89 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0678  HAD family hydrolase  26.39 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000169534  hitchhiker  0.0000480056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  28.85 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02970  4-nitrophenylphosphatase (AFU_orthologue; AFUA_3G08310)  27.41 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.509527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  29.28 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2849  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.1 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0335  UMP phosphatase  29.03 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00626353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.11 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2912  UMP phosphatase  29.03 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141408  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3000  UMP phosphatase  29.03 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161111  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  26 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1837  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.49 
 
 		 274 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.25 
 
 		 675 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  27.09 
 
 		 259 aa  52.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0169  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.74 
 
 		 264 aa  52.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.54 
 
 		 344 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  27.8 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.84 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.029851  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1254  HAD family sugar phosphatase  25.9 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0106686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1190  UMP phosphatase  26.53 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114642  hitchhiker  0.000177666 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  25.1 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1914  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.51 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00534341  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0317  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  23.9 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.937319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3034  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.77 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4076  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.24 
 
 		 366 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.125935  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1214  HAD family sugar phosphatase  24.6 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000012407  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.3 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2752  phosphoglycolate phosphatase  35.58 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.31 
 
 		 264 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931975  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2038  HAD family hydrolase  25.76 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1594  UMP phosphatase  27.49 
 
 		 248 aa  49.7  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000808476  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00632  UMP phosphatase  27.02 
 
 		 250 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000712953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2962  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.02 
 
 		 250 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000529801  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0719  UMP phosphatase  27.02 
 
 		 250 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000961731  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0700  UMP phosphatase  27.02 
 
 		 250 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0766  UMP phosphatase  27.02 
 
 		 250 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000485352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00623  hypothetical protein  27.02 
 
 		 250 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2981  UMP phosphatase  27.02 
 
 		 250 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00141438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0695  UMP phosphatase  27.02 
 
 		 250 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00424094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>