199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0410 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  100 
 
 		 282 aa  577  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  60.99 
 
 		 282 aa  348  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  60.64 
 
 		 282 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  60.64 
 
 		 282 aa  338  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  56.18 
 
 		 283 aa  337  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  55.64 
 
 		 283 aa  308  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  54.04 
 
 		 282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  53.6 
 
 		 286 aa  293  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  49.47 
 
 		 300 aa  265  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  49.42 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  48.64 
 
 		 284 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  48.68 
 
 		 286 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  49.8 
 
 		 284 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  48.8 
 
 		 284 aa  241  7e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.49 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  46.97 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  46.91 
 
 		 290 aa  238  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  50.39 
 
 		 301 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  46.01 
 
 		 284 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  49.21 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  48.43 
 
 		 295 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  51.57 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  43.73 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.43 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  48.22 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  44.25 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  38.36 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  38.7 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  37.67 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.97 
 
 		 290 aa  195  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  41.78 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  42.75 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  45.42 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  38.46 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  37.37 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.31 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  37.14 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  37.25 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  30.83 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  32.63 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  34.84 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  30.95 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  35.89 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  28.09 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  30.15 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  32.62 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  32.12 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  31.01 
 
 		 280 aa  96.3  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  26.59 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  28.67 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  24.58 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14240  haloacid dehalogenase subfamily IIA protein  29.44 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00966269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  30.45 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.51 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.05 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1655  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0557426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  28.33 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  29.29 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  25.85 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  24.31 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1514  HAD family hydrolase  26.36 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  29.34 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.2 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.13 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.81 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25490  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  25.94 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  29.63 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  26.1 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.74 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22170  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  25.98 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1190  UMP phosphatase  26.3 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114642  hitchhiker  0.000177666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1338  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.38 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.89 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.338548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0576  UMP phosphatase  27.31 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0275278  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00632  UMP phosphatase  27.31 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000712953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2962  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.31 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000529801  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0766  UMP phosphatase  27.31 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000485352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00623  hypothetical protein  27.31 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  26.51 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2981  UMP phosphatase  27.31 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00141438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0695  UMP phosphatase  27.31 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00424094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0719  UMP phosphatase  27.31 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000961731  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0700  UMP phosphatase  27.31 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385389  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55335  p-nitrophenyl phosphatase  23.81 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424742  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0800  putative HAD superfamily sugar phosphatase  28.4 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0800  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3000  UMP phosphatase  27.62 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161111  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0836  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0728  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0740  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  normal  0.752742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0787  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  0.744456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2359  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.08 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0246768  hitchhiker  0.00643781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2912  UMP phosphatase  27.62 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141408  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1620  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.84 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3163  HAD family hydrolase  27.82 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0117236  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.57 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1300  HAD family hydrolase  24.65 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  24.26 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>