103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3159 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  100 
 
 		 284 aa  580  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  88.03 
 
 		 284 aa  527  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  76.41 
 
 		 284 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  76.06 
 
 		 284 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  74.3 
 
 		 284 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  74.3 
 
 		 284 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  73.94 
 
 		 284 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  46.26 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  45.69 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  44.44 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  48.26 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.39 
 
 		 301 aa  248  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  46.85 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  49.44 
 
 		 282 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  48.31 
 
 		 282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  47.45 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  46.13 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  49.06 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.06 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  44.24 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  48.58 
 
 		 290 aa  238  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  47.53 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  45.14 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  46.27 
 
 		 295 aa  234  9e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  45.52 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  45.52 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  43.73 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  44.52 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  43.28 
 
 		 297 aa  218  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  44.24 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  41.73 
 
 		 290 aa  214  9e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  44 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  40.28 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  43.87 
 
 		 283 aa  204  9e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  39.15 
 
 		 291 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  35.07 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  34.58 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  36.4 
 
 		 295 aa  142  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  38.21 
 
 		 281 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  29.6 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  31.42 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  35.07 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  35.8 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  31.45 
 
 		 280 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  33.85 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  35.07 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  29.89 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  28.15 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  29.84 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  25.37 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  25.55 
 
 		 351 aa  85.5  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.3 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  28.97 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  29.85 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.34 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.46 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.76 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  24.32 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  28.05 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  29.51 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  24.21 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  25.73 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  25.71 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.21 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2849  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.46 
 
 		 266 aa  52.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2722  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.05 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  27.94 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07430  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.33 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1620  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.39 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0169  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.9 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  27.69 
 
 		 336 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55335  p-nitrophenyl phosphatase  25.62 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424742  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  24.9 
 
 		 273 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5096  phosphatase  23.11 
 
 		 254 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.344211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4668  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  23.11 
 
 		 254 aa  48.9  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4685  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  23.11 
 
 		 254 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5101  phosphatase,haloacid dehalogenase family  23.11 
 
 		 254 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.348234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5063  phosphatase,haloacid dehalogenase family  23.11 
 
 		 254 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4827  phosphatase  23.11 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00162438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5192  phosphatase  23.11 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.183726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0137  phosphatase,haloacid dehalogenase family  23.9 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.651243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.74 
 
 		 675 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  27.39 
 
 		 333 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0892  HAD superfamily hydrolase  24.29 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.65538  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11708  phosphatase  26.88 
 
 		 353 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.900168  normal  0.127356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3163  HAD family hydrolase  40.58 
 
 		 449 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0117236  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  25.73 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0800  putative HAD superfamily sugar phosphatase  27.6 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0142  HAD family hydrolase  23.93 
 
 		 254 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3292  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3022  HAD family hydrolase  27.24 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.446988  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3557  HAD family hydrolase  22.31 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5102  phosphatase,haloacid dehalogenase family  22.71 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.19 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0563  HAD family hydrolase  25.1 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0984026  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.46 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.029851  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.34 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0678  HAD family hydrolase  25.9 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000169534  hitchhiker  0.0000480056 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3248  HAD family hydrolase  26.83 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>