113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0386 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  100 
 
 		 301 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  79.4 
 
 		 301 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  64.48 
 
 		 295 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  67.92 
 
 		 296 aa  364  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  64.48 
 
 		 295 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  64.48 
 
 		 295 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  50.83 
 
 		 300 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  49.82 
 
 		 284 aa  258  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  48.08 
 
 		 284 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  47.39 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  47.39 
 
 		 284 aa  251  9.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  50 
 
 		 286 aa  248  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  49.61 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  45.99 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  50.39 
 
 		 282 aa  244  9e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  50.2 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  49.61 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  46.21 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  44.37 
 
 		 282 aa  238  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  45.52 
 
 		 283 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  46.05 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  46.93 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  47.55 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  45 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  46.21 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  41.53 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  41.2 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  42.91 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  40.2 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  43.92 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  38.44 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  43.09 
 
 		 281 aa  179  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  44.57 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  40.34 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.85 
 
 		 290 aa  175  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  36.36 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  30.3 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  41.09 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  33.46 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  40.23 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  38 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  34.87 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  30.38 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  28.43 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  29.93 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  29.9 
 
 		 351 aa  89  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  30.45 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  30.13 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  28.74 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  31.15 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.1 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  27.86 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.6 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.36 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  28.2 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2038  HAD family hydrolase  28.69 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  23.46 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.74 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1620  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.24 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  25 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  25.67 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2849  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.4 
 
 		 266 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  28.17 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3163  HAD family hydrolase  31.1 
 
 		 449 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0117236  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.9 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  27.75 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5096  phosphatase  25.09 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.344211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4668  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  25.09 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265618  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  27.75 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5101  phosphatase,haloacid dehalogenase family  25.09 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.348234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5063  phosphatase,haloacid dehalogenase family  25.09 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4827  phosphatase  25.09 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00162438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4685  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  25.09 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5192  phosphatase  25.09 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.183726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.15 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.71 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0137  phosphatase,haloacid dehalogenase family  25.09 
 
 		 254 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.651243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.56 
 
 		 344 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.91 
 
 		 675 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  27.71 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25490  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.79 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  30.17 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0544  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  35.85 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  26.83 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  26.92 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0800  putative HAD superfamily sugar phosphatase  28.11 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5102  phosphatase,haloacid dehalogenase family  24.72 
 
 		 254 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22170  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  27.24 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  27.2 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  33.96 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.28866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  37 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2419  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  29.71 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0317  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  23.44 
 
 		 275 aa  45.8  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.937319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2563  HAD family hydrolase  25.7 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1749  HAD family hydrolase  31.06 
 
 		 366 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0343675  hitchhiker  0.000628636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1592  HAD family hydrolase  34.78 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  33.96 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>