297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3644 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  100 
 
 		 282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  71.17 
 
 		 282 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  63.83 
 
 		 283 aa  391  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.93 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  29.39 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59523  p-Nitrophenyl phosphatase  28.99 
 
 		 320 aa  96.7  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.400551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2757  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.16 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  28.83 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33094  predicted protein  30.45 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.24 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  27.45 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55335  p-nitrophenyl phosphatase  29.39 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424742  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3015  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.12 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0572  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.96 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.641297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.92 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  29.96 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  27.69 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  27.34 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  27.31 
 
 		 343 aa  82  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  28.3 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  26.17 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  27.44 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  24.54 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3145  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.69 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1955  HAD family hydrolase  29.84 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1898  HAD family hydrolase  27.68 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1975  HAD family hydrolase  30.08 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  26.34 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2021  HAD family hydrolase  30.08 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  26.35 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2196  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0678  HAD family hydrolase  29.86 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000169534  hitchhiker  0.0000480056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.53 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  25.84 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  24.26 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0800  UMP phosphatase  26.79 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0656  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.51 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2607  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.54 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0836  UMP phosphatase  26.79 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0728  UMP phosphatase  26.79 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0787  UMP phosphatase  26.79 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  0.744456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1514  HAD family hydrolase  28.92 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0740  UMP phosphatase  26.79 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  normal  0.752742 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2187  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.17 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0794654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.05 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.029851  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  29.1 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35270  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  27.87 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  27.59 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  26.89 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1190  UMP phosphatase  26.42 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114642  hitchhiker  0.000177666 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  27.48 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14240  haloacid dehalogenase subfamily IIA protein  28.69 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00966269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1592  HAD family hydrolase  26.82 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  24.31 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1760  HAD family hydrolase  28.05 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0798453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  26.56 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2194  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.63 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1907  HAD family hydrolase  27.24 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2099  UMP phosphatase  28.34 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204469  normal  0.749352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2762  UMP phosphatase  27.76 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.55 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1224  UMP phosphatase  26.15 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387552  normal  0.0757281 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  29.02 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3643  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.46 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.52 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  26.97 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4181  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.86 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.646523  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3022  HAD family hydrolase  27.87 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.446988  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3248  HAD family hydrolase  28.69 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.1 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4736  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.24 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  24.83 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  29.02 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0233  HAD family hydrolase  27.95 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04360  4-nitrophenylphosphatase, putative  26.46 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2382  UMP phosphatase  27.76 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0204611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2454  UMP phosphatase  27.35 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.010587  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2547  UMP phosphatase  27.35 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000020241  normal  0.838797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1914  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.64 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00534341  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  26.59 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4163  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.97 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.81021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.29 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0544  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.2 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25490  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  25.45 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1605  UMP phosphatase  28.16 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000109056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  27.34 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00632  UMP phosphatase  25.66 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000712953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2962  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.66 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000529801  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2981  UMP phosphatase  25.66 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00141438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0700  UMP phosphatase  25.66 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0766  UMP phosphatase  25.66 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000485352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0846  HAD family hydrolase  26.8 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578477  normal  0.241059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0990  HAD family hydrolase  26.8 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.383042  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0576  UMP phosphatase  25.66 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0275278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0719  UMP phosphatase  25.66 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000961731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.27 
 
 		 675 aa  69.3  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  29.01 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00623  hypothetical protein  25.66 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>