191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1719 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  100 
 
 		 284 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  76.06 
 
 		 284 aa  443  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  75 
 
 		 284 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  74.3 
 
 		 284 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  71.48 
 
 		 284 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  73.59 
 
 		 284 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  72.89 
 
 		 284 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  49.82 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  47.84 
 
 		 282 aa  261  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  50.57 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  48.56 
 
 		 283 aa  254  8e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  48.05 
 
 		 283 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  49.82 
 
 		 301 aa  251  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  49.8 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  50.35 
 
 		 301 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  46.59 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  49.81 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  49.23 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  49.24 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  47.77 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  44.9 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  49.42 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  46.01 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  49.03 
 
 		 282 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  48.65 
 
 		 282 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  46.36 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  45.98 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  45.59 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  44.04 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  40.88 
 
 		 281 aa  206  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  43.55 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  41.91 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  40.66 
 
 		 290 aa  202  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  43.17 
 
 		 289 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  39.18 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  35.82 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  35.66 
 
 		 295 aa  148  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  40.59 
 
 		 281 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  34.78 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  30.26 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  32.97 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  30.88 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.25 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  32.08 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  33.22 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  34.83 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  31.4 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  27.87 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  30.89 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  30.17 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.17 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  25.4 
 
 		 351 aa  85.9  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  26.25 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.44 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  27.71 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  25.49 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  32.4 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.67 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  26.32 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  26.86 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3022  HAD family hydrolase  28.16 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.446988  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.69 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  25.21 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  26.53 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1620  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.5 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  27.8 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  30.42 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3248  HAD family hydrolase  27.69 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  27.57 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2722  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.17 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.46 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0800  putative HAD superfamily sugar phosphatase  28.29 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07430  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.51 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.78 
 
 		 675 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0563  HAD family hydrolase  25.78 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0984026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1592  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3498  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.63 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.622356  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2849  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.1 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35270  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  27.12 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0169  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.25 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14240  haloacid dehalogenase subfamily IIA protein  29.08 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00966269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0515  HAD superfamily hydrolase  23.35 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0137  phosphatase,haloacid dehalogenase family  25.68 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.651243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55335  p-nitrophenyl phosphatase  24.65 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424742  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3557  HAD family hydrolase  26.45 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  27.84 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2563  HAD family hydrolase  25.09 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0142  HAD family hydrolase  24.68 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.78 
 
 		 306 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  26.75 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2196  HAD family hydrolase  25.29 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5102  phosphatase,haloacid dehalogenase family  25.68 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5096  phosphatase  25.68 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.344211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4668  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  25.68 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4685  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  25.68 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5101  phosphatase,haloacid dehalogenase family  25.68 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.348234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5063  phosphatase,haloacid dehalogenase family  25.68 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4827  phosphatase  25.68 
 
 		 254 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00162438  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.83 
 
 		 344 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>