87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2925 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 		 290 aa  589  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  66.67 
 
 		 291 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  68.97 
 
 		 290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  55.89 
 
 		 297 aa  322  4e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  55.56 
 
 		 297 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  53.54 
 
 		 297 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  54.76 
 
 		 289 aa  285  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  42.41 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  44.24 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  40.36 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  40.29 
 
 		 284 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  41.63 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  41.44 
 
 		 286 aa  205  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  42.7 
 
 		 284 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  40.66 
 
 		 284 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  39.58 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  42.53 
 
 		 284 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  38.83 
 
 		 283 aa  195  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  38.97 
 
 		 282 aa  195  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  39.52 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  37.46 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  37.8 
 
 		 282 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  39.59 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  37.8 
 
 		 282 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  38.1 
 
 		 281 aa  178  9e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  39.03 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  38.31 
 
 		 301 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  36.86 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  37.85 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  37.07 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  38.46 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  36.49 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  37.33 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  35.86 
 
 		 299 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  35.14 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  37.46 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  35.47 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  31.01 
 
 		 274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  29.79 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  33.67 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  35.07 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  32.17 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  31.7 
 
 		 292 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  31.99 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  29.35 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  29.04 
 
 		 299 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  34.59 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  31.08 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  27.73 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  25.16 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  24.33 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  29.05 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  23.57 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0800  putative HAD superfamily sugar phosphatase  26.64 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  26.77 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  22.14 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  25.86 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  25 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  28.03 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  24.32 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  26.36 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  23.59 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0892  HAD superfamily hydrolase  25.3 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.65538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2038  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 334 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.5 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.26 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4076  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.29 
 
 		 366 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.125935  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  27.05 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  23.81 
 
 		 336 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  24.8 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1362  hypothetical protein  33.66 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1338  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.47 
 
 		 338 aa  46.6  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  26.88 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1254  HAD family sugar phosphatase  26.1 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0106686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1514  HAD family hydrolase  25.09 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  27.71 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2849  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.63 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04360  4-nitrophenylphosphatase, putative  23.26 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0678  HAD hydrolase, family IIA  24.41 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1655  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.89 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0557426  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0169  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.44 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0678  HAD family hydrolase  24.82 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000169534  hitchhiker  0.0000480056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.69 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.029851  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0563  HAD family hydrolase  23.86 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0984026  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  23.62 
 
 		 342 aa  42.7  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>