152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1328 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  100 
 
 		 299 aa  606  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  52.22 
 
 		 294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  48.25 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  46.85 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  47.55 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  45.83 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  44.9 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  46.18 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  45.49 
 
 		 284 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  46.05 
 
 		 301 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  44.07 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  43.54 
 
 		 286 aa  219  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  44.26 
 
 		 301 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  44.25 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  42.71 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  44.01 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  40.14 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  39.8 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  41.52 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  42.28 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  42.41 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  41.72 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  40.6 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  40.6 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  46.61 
 
 		 289 aa  198  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  41.61 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  42.07 
 
 		 282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  39.86 
 
 		 297 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  41.87 
 
 		 282 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  39.66 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  40.77 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  41.3 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  36.49 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  37.87 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  37.58 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.86 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  35.59 
 
 		 284 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  34.69 
 
 		 288 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  36.18 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  36.43 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  30.86 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  32.68 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  30.87 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  31.74 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  30.56 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  30.58 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  31.27 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  31.99 
 
 		 280 aa  99.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  28.99 
 
 		 294 aa  95.9  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  29.76 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  26.89 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  24.79 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  29.09 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3163  HAD family hydrolase  29.79 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0117236  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.57 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  27.46 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0678  HAD family hydrolase  28.36 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000169534  hitchhiker  0.0000480056 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  27.21 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.61 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2581  UMP phosphatase  25.73 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2762  UMP phosphatase  25.93 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0169  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.11 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  28.63 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1840  UMP phosphatase  25.1 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000453857  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2038  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2382  UMP phosphatase  25.51 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0204611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2454  UMP phosphatase  25.51 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.010587  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2547  UMP phosphatase  25.51 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000020241  normal  0.838797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.27 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.029851  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1511  UMP phosphatase  25.51 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000195754  normal  0.444742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  23.72 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  27.24 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2099  UMP phosphatase  25.1 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204469  normal  0.749352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1592  HAD family hydrolase  28.1 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1749  HAD family hydrolase  27.95 
 
 		 366 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0343675  hitchhiker  0.000628636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.97 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1594  UMP phosphatase  25.1 
 
 		 248 aa  53.1  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000808476  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1733  UMP phosphatase  24.69 
 
 		 248 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000210359  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1728  UMP phosphatase  24.69 
 
 		 248 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000338596  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2551  UMP phosphatase  24.69 
 
 		 248 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000346964  unclonable  0.00000000000937616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1771  UMP phosphatase  24.69 
 
 		 248 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000884824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07430  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  27.54 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1605  UMP phosphatase  24.69 
 
 		 248 aa  52.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000109056  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0794  HAD family hydrolase  26.52 
 
 		 257 aa  52.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1840  UMP phosphatase  24.69 
 
 		 248 aa  52.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.272737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2504  HAD superfamily sugar phosphatase  24.62 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.22 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2746  UMP phosphatase  24.28 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000506878  hitchhiker  0.000386966 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  24.48 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.2 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.16 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1190  UMP phosphatase  24.58 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114642  hitchhiker  0.000177666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  28.51 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  26 
 
 		 255 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  25.31 
 
 		 259 aa  50.1  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2849  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.5 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0515  HAD family hydrolase  27.05 
 
 		 276 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22170  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  25.45 
 
 		 345 aa  49.7  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>