140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2434 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  100 
 
 		 274 aa  566  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  32.37 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  32.14 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  31.76 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  35.46 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  32.97 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  31.21 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  35.06 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  30.26 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.01 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  32.08 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  30.35 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  30.63 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  30.2 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  32.94 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.2 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  28.88 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.3 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  29.6 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  30.07 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  30.83 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.02 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  30.86 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  28.01 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  27.76 
 
 		 301 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  31.64 
 
 		 289 aa  118  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  30.86 
 
 		 299 aa  118  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  35.63 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  28.23 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  28.32 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  29.57 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  32.11 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  30.8 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.79 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  29.01 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  31.27 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.4 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  28.83 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  28.95 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  28.95 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  30.45 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.24 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.63 
 
 		 282 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  27.51 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  25.63 
 
 		 351 aa  92.4  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  26.92 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  26.16 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  25.8 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  25.63 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.95 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  28.23 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  25.76 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0448  hydrolase  25.61 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000127842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  26.02 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  26.42 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  25.58 
 
 		 304 aa  62  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3221  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  21.07 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07430  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  26.41 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  21.67 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.7 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0169  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.13 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1911  HAD-superfamily hydrolase  20.97 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1592  HAD family hydrolase  25.71 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  22.48 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4163  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  19.92 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.81021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0281  HAD family hydrolase  25.2 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  24.07 
 
 		 336 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35270  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  21.27 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0678  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000169534  hitchhiker  0.0000480056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1242  HAD family hydrolase  22.06 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319101  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  20.74 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2762  UMP phosphatase  23.83 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  21.58 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.12 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.029851  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3145  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  20.59 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0544  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  21.52 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  20.28 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2196  HAD family hydrolase  21.29 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1840  UMP phosphatase  23.98 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000453857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2746  UMP phosphatase  23.98 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000506878  hitchhiker  0.000386966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1605  UMP phosphatase  23.72 
 
 		 248 aa  49.7  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000109056  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1511  UMP phosphatase  22.66 
 
 		 252 aa  49.7  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000195754  normal  0.444742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2607  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  23.53 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4181  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  19.85 
 
 		 260 aa  49.7  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.646523  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1975  HAD family hydrolase  21.43 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2021  HAD family hydrolase  21.43 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  24.79 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  22.36 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2581  UMP phosphatase  23.05 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2382  UMP phosphatase  23.05 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0204611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2454  UMP phosphatase  23.05 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.010587  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2547  UMP phosphatase  23.05 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000020241  normal  0.838797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1955  HAD family hydrolase  21.43 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1224  UMP phosphatase  23.9 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387552  normal  0.0757281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  19.92 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15000  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  21.25 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.039649  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1840  UMP phosphatase  23.17 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.272737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3034  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.5 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  0.86283 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>