206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0515 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0515  HAD family hydrolase  100 
 
 		 295 aa  587  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  45.26 
 
 		 284 aa  223  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0642  HAD family hydrolase  41.3 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1960  HAD family hydrolase  45.34 
 
 		 280 aa  192  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1844  HAD family hydrolase  37.29 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0896  HAD family hydrolase  40.15 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.289944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1328  HAD family hydrolase  37.58 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.986984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2306  putative HAD superfamily protein  36.39 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1372  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  37.6 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2194  HAD family hydrolase  37.84 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0410  HAD family hydrolase  37.14 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4050  HAD family hydrolase  38.97 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0386  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  36.61 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1182  HAD family hydrolase  37.74 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786523 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0981  HAD family hydrolase  36.05 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2925  putative Haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.46 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.599957  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2225  HAD family hydrolase  36.25 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202904  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0423  HAD family hydrolase  38.49 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3660  HAD family hydrolase  39.16 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2539  HAD family hydrolase  37.07 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1286  HAD family hydrolase  35.27 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  0.0567412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1719  putative hydrolase  35.66 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1500  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  35.67 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  0.471127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1778  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  35.57 
 
 		 295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1499  HAD family hydrolase  34.56 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.287599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5827  hypothetical protein  35.44 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1165  HAD family hydrolase  35.76 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0199  HAD superfamily hydrolase  36.24 
 
 		 283 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3159  HAD family hydrolase  36.4 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4280  HAD family hydrolase  37.22 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0895172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  37.15 
 
 		 282 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0681  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.95 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.388664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0608  HAD family hydrolase  37.85 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.148243 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3029  HAD family hydrolase  35.89 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  37.28 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2153  HAD family hydrolase  33.45 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13650  hypothetical protein  33.8 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3363  HAD family hydrolase  34.49 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1222  hypothetical protein  34.75 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  36.46 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0589  HAD family hydrolase  34.93 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195304 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2434  HAD family hydrolase  31.23 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2188  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  36.62 
 
 		 279 aa  139  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3222  hypothetical protein  32.06 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2021  HAD family hydrolase  35.14 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13322  predicted protein  29.63 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.883316  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_41894  predicted protein  32.03 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2563  HAD family hydrolase  31.39 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1394  HAD family hydrolase  33.07 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305985 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36356  predicted protein  29.83 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1795  HAD family hydrolase  31.5 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3489  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  29.96 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0854  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.13 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4065  HAD family hydrolase  24.26 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  30.82 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0563  HAD family hydrolase  27.42 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0984026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5411  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.1 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.01602  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1888  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.772314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.83 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.029851  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2722  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.91 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  31.39 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  26.14 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  26.14 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.61 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041725 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.05 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3015  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.34 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2698  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.15 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182106  normal  0.0745775 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3150  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  35.34 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.714605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0317  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.937319  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1338  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.2 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3163  HAD family hydrolase  29.72 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0117236  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22170  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  30.55 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  25 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1837  phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  23.05 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1655  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  33.68 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0557426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3644  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  22.31 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  29.57 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0800  UMP phosphatase  27.35 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0740  UMP phosphatase  27.35 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  normal  0.752742 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0324  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  28.91 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.984086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0787  UMP phosphatase  27.35 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  0.744456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0728  UMP phosphatase  27.35 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0836  UMP phosphatase  27.35 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.53 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00632  UMP phosphatase  27.23 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000712953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2962  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.23 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000529801  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0700  UMP phosphatase  27.23 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385389  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2981  UMP phosphatase  27.23 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00141438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0576  UMP phosphatase  27.23 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0275278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00623  hypothetical protein  27.23 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0766  UMP phosphatase  27.23 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000485352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0695  UMP phosphatase  27.23 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00424094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0719  UMP phosphatase  27.23 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000961731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2752  phosphoglycolate phosphatase  28.02 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1898  HAD family hydrolase  32.93 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3425  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.89 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000345532  hitchhiker  0.0000983419 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  28.4 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1190  UMP phosphatase  26.38 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114642  hitchhiker  0.000177666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>